Revue de bibliographie quotidienne Covid-19 (archives du 10 juillet 2021 au 26 août 2021)

Publié par Bernard Pradines

Sans me livrer à une vraie revue de la littérature scientifique, je repère surtout les publications qui me semblent dignes d’intérêt depuis le 18 mars 2021 (voir aussi les archives 1, archives 2 ) dans le listing quotidien de Kamps et Hoffmann : https://covidreference.com/top10

Remarques en français en caractères bleus.

A noter que les mises à jour de cette page ne feront pas systématiquement l'objet d'un avis de publication par courriel comme les autres articles.

26 août 2021

Fowlkes A, Gaglani M, Groover K, et al. Effectiveness of COVID-19 Vaccines in Preventing SARS-CoV-2 Infection Among Frontline Workers Before and During B.1.617.2 (Delta) Variant Predominance — Eight U.S. Locations, December 2020–August 2021. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. ePub: 24 August 2021. https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/70/wr/mm7034e4.htm?s_cid=mm7034e4_x

Dans cette cohorte de 4217 travailleurs de première ligne (principalement des travailleurs de la santé), l'efficacité du vaccin (EV) est passée de 91 % à 66 % lorsque le variant SARS-CoV-2 Delta est devenu prédominant. Cependant, cette tendance doit être interprétée avec prudence (augmentation du temps écoulé depuis la vaccination, faibles effectifs).

In this cohort of 4217 frontline workers (mainly HCW), the vaccine effectiveness (VE) declined from 91% to 66% when the SARS-CoV-2 Delta variant became predominant. However, this trend should be interpreted with caution (increasing time since vaccination, low numbers).

Behrens GM, Cossmann A, Stankov MV, et al. SARS-CoV-2 delta variant neutralisation after heterologous ChAdOx1-S/BNT162b2 vaccination. Lancet August 17, 2021. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)01891-2

D'après les auteurs, l'inhibition du variant Delta est robuste avec une séquence AstraZeneca - Pfizer. 

Robust inhibition of variants including Delta by the switch vaccination of AZ then Pfizer/BNT.

Griffin JB, Haddix M, Danza P, et al. SARS-CoV-2 Infections and Hospitalizations Among Persons Aged ≥16 Years, by Vaccination Status — Los Angeles County, California, May 1–July 25, 2021. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. ePub: 24 August 2021. https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/70/wr/mm7034e5.htm?s_cid=mm7034e5_w

Du 1er mai au 25 juillet 2021, parmi 43 127 infections au SRAS-CoV-2 chez les résidents du comté de Los Angeles, 25,3 % étaient des personnes entièrement vaccinées, 3,3 % étaient des personnes partiellement vaccinées et 71,4 % étaient des personnes non vaccinées. Le 25 juillet, les taux d'infection et d'hospitalisation chez les personnes non vaccinées étaient respectivement de 4,9 et 29,2 fois supérieurs à ceux des personnes complètement vaccinées. Il est à noter qu'en juillet, lorsque le Delta était prédominant, les valeurs seuils du Ct étaient similaires pour les personnes non vaccinées et vaccinées.

From May 1–July 25, 2021, among 43,127 SARS-CoV-2 infections in residents of Los Angeles County, 25.3% were in fully vaccinated persons, 3.3% were in partially vaccinated persons, and 71.4% were in unvaccinated persons. On July 25, infection and hospitalization rates among unvaccinated persons were 4.9 and 29.2 times, respectively, those of fully vaccinated persons. Of note, in July, when Delta was predominant, cycle threshold values were similar for unvaccinated and vaccinated persons.

Ong SW, Chiew CJ, Ang LW, et al. Clinical and virological features of SARS-CoV-2 variants of concern: a retrospective cohort study comparing B.1.1.7 (Alpha), B.1.315 (Beta), and B.1.617.2 (Delta). Clin Inf Dis August 23, 2021; ciab721, https://doi.org/10.1093/cid/ciab721

Cohorte rétrospective de Singapour, indiquant une tendance vers une sévérité accrue associée à B.1.617.2 (Delta). L'association de B.1.617.2 avec une valeur seuil de Ct inférieure et une excrétion virale plus longue fournit un mécanisme potentiel pour une transmissibilité accrue. Les 18 patients vaccinés avec Delta avaient tous une maladie bénigne et aucun n'a développé de pneumonie.

Retrospective cohort from Singapore, indicating a signal toward increased severity associated with B.1.617.2 (Delta). The association of B.1.617.2 with lower cycle threshold value and longer viral shedding provides a potential mechanism for increased transmissibility. All of 18 vaccinated patients with Delta had mild disease and none developed pneumonia.

25 août 2021

Wan EY, Chui CD, Lai FT, et al. Bell’s palsy following vaccination with mRNA (BNT162b2) and inactivated (CoronaVac) SARS-CoV-2 vaccines: a case series and nested case-control study. Lancet Inf Dis August 16, 2021. DOI: https://doi.org/10.1016/S1473-3099(21)00451-5

Paralysies faciales suite à la vaccination avec un vaccin à ARNm (BNT162b2-Pfizer) et un inactivé (CoronaVac) anti-SARS-CoV-2 : une série de cas et une étude cas-témoins appariée.

4,8 cas supplémentaires (par rapport à son incidence habituelle) de cet événement indésirable généralement résolutif pour 100 000 personnes vaccinées avec CoronaVac et 2,0 cas pour 100 000 personnes vaccinées avec BNT162b2 (Pfizer).

An additional 4.8 cases of this generally self-limiting adverse event per 100,000 people vaccinated with CoronaVac and 2.0 cases per 100,000 people vaccinated with BNT162b2.

Ehrmann S, Li J, Ibarra-Estrada M, et al. Awake prone positioning for COVID-19 acute hypoxaemic respiratory failure: a randomised, controlled, multinational, open-label meta-trial. Lancet Resp Med, August 20, 2021. https://doi.org/10.1016/S2213-2600(21)00356-8

Ce méta-essai collaboratif de six essais de supériorité contrôlés randomisés en ouvert montre que le positionnement à plat ventre des patients éveillés atteints d'insuffisance respiratoire hypoxémique due à COVID-19 réduit le besoin d'intubation sans aucun préjudice. 14 patients éveillés traités en position à plat ventre évitent une intubation.

This collaborative meta-trial of six randomized controlled open label superiority trials shows that awake prone positioning of patients with hypoxemic respiratory failure due to COVID-19 reduces the need for intubation with no signs of harm. 14 patients treated with awake prone positioning avoids one intubation.

24 août 2021

Moritz S, Gottschick C, Horn J, et al. The risk of indoor sports and culture events for the transmission of COVID-19. Nat Commun August 2021, 12, 5096. https://www.nature.com/articles/s41467-021-25317-9

Les auteurs ont dirigé un concert pop « expérimental » (la musique était mainstream) le 22 août 2020, avec un total de 1212 personnes à la Leipzig Arena, en Allemagne. Ils concluent qu'avec un système de ventilation efficace, les événements de rassemblement de masse à l'intérieur avec des pratiques d'hygiène appropriées ont un effet très faible, voire inexistant, sur la propagation de l'épidémie. Si vous êtes intéressé par le système de ventilation dans l'arène : l'air d'admission est soufflé latéralement sur les côtés est et ouest par des buses à jet. https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41467-021-25317-9/MediaObjects/41467_2021_25317_MOESM7_ESM.mp4

The authors conducted an “experimental” pop concert (music was mainstream) on August 22nd 2020, with a total of 1212 individuals in the Leipzig Arena, Germany. They conclude that with an effective ventilation system, indoor mass gathering events with suitable hygiene practices have a very small, if any, effect on epidemic spread. If you are interested in the ventilation system in the arena: the inlet air is blown in laterally on the east- and west side by jet nozzles. https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41467-021-25317-9/MediaObjects/41467_2021_25317_MOESM7_ESM.mp4

23 août 2021

Eliakim-Raz N, Massarweh A, Stemmer A, Stemmer SM. Durability of Response to SARS-CoV-2 BNT162b2 Vaccination in Patients on Active Anticancer Treatment. JAMA Oncol. 2021 Aug 11:e214390. PubMed: https://pubmed.gov/34379092. Full text: https://doi.org/10.1001/jamaoncol.2021.4390

La réponse en anticorps IgG anti-spike (anti-S) au vaccin BioNTech/Pfizer chez 95 patients atteints de tumeurs solides sous traitement anticancéreux actif après une médiane de 4 mois à compter de la deuxième vaccination. Quatre-vingt-trois patients (87 %) étaient séropositifs pour les anticorps IgG anti-S. Les niveaux de titre médians chez les patients atteints de cancer étaient significativement inférieurs à ceux du groupe témoin. Il y avait un intervalle de 3,6 fois dans les valeurs de titre médian entre les types de tumeurs et un intervalle plus large (8,8 fois) entre les types de traitement. La seule variable significativement associée à des titres d'IgG inférieurs était le traitement par chimiothérapie plus immunothérapie et immunothérapie plus thérapie biologique.

Anti-spike (anti-S) IgG antibody response to the BioNTech/Pfizer vaccine in 95 patients with solid tumors on active anti-cancer treatment after a median of 4 months from the second vaccination. Eighty-three patients (87%) were seropositive for anti-S IgG antibodies. The median titer levels in patients with cancer was significantly lower than those in the control group. There was a 3.6-fold range in median titer values across tumor types and a wider range (8.8-fold) across treatment types. The only variable significantly associated with lower IgG titers was treatment with chemotherapy plus immunotherapy and immunotherapy plus biological therapy.

Bartels J, Fairfield C, Chen IC, Neu D. Laboratory Study of Physical Barrier Efficiency for Worker Protection against SARS-CoV-2 while Standing or Sitting. medRxiv 2021, posted 29 July. Full text: https://doi.org/10.1101/2021.07.26.21261146

Les masques sont plus efficaces que les barrières en plexiglas. Les auteurs constatent une réduction de plus de 70 % de l'exposition aux aérosols provenant de toux simulées, mais les barrières de plexiglas augmentent l'exposition aux autres personnes à proximité et peuvent entraver une ventilation adéquate. Les barrières en plexiglas détournent les aérosols, les masques les éliminent.

Masks are better than plexiglass barriers. The authors find a more than 70% reduction in exposure to aerosols from simulated coughs, but barriers increase exposure to other people nearby and may impede proper ventilation. Plexiglass barriers divert aerosols, masks remove them.

Brink J, Cullen P, Beek K, Peters SAE. Intimate Partner Violence during the Covid-19 pandemic in Western and Southern European countries. Eur J Public Health. 2021 Aug 18:ckab093. PubMed: https://pubmed.gov/34406373. Full text: https://doi.org/10.1093/eurpub/ckab093

« Six pays ont enregistré une augmentation des signalements de violence domestique (Autriche, Belgique, France, Irlande, Espagne et Royaume-Uni), deux pays une baisse (Italie et Portugal), deux pays n'ont montré aucun changement (Pays-Bas et Suisse) et un le pays n'a pas fourni de données comparatives (Allemagne).

“Six countries showed an increase in domestic violence reports (Austria, Belgium, France, Ireland, Spain, and the UK), two countries a drop (Italy and Portugal), two countries showed no change (the Netherlands and Switzerland), and one country did not provide comparative data (Germany).”

22 août 2021

Resende PC, Naveca FG, Lins RD, et al. The Ongoing Evolution of Variants of Concern and Interest of SARS-CoV-2 in Brazil Revealed by Convergent Indels in the Amino (N)-Terminal Domain of the Spike Protein. Virus Evolution 2021, published 14 August. Full text: https://doi.org/10.1093/ve/veab069

Brésil : de nouveaux variants à prévoir, possiblement davantage résistants aux anticorps neutralisants.

The authors identified that SARS-CoV-2 lineages circulating in Brazil independently acquired convergent deletions and insertions in the amino (N)-terminal domain (NTD) of the S protein. They anticipate that ongoing widespread transmission of SARS-CoV-2 will generate new viral lineages that might be more resistant to antibody neutralization.

 Korley FK, Durkalski-Mauldin V, Yeatts SD, et al. Early Convalescent Plasma for High-Risk Outpatients with Covid-19. N Engl J Med. 2021 Aug 18. PubMed: https://pubmed.gov/34407339. Full text: https://doi.org/10.1056/NEJMoa2103784

Plasma de convalescent : un chapitre à clore ?

Time to close the chapter on convalescent plasma? In this randomized, multicenter, single-blind trial (257 in the convalescent plasma group and 254 in the placebo group), the administration of COVID-19 convalescent plasma to high-risk outpatients within 1 week after the onset of symptoms of COVID-19 did not prevent disease progression

21 août 2021

Chinn J, Sedighim S, Kirby KA, et al. Characteristics and Outcomes of Women With COVID-19 Giving Birth at US Academic Centers During the COVID-19 Pandemic. JAMA Netw Open. 2021 Aug 2;4(8):e2120456. PubMed: https://pubmed.gov/34379123. Full text: https://doi.org/10.1001/jamanetworkopen.2021.20456

Bon, mieux vaut ne pas associer covid-19 et grossesse.

Women with COVID-19 giving birth had increased mortality, need for intubation and ventilation, and intensive care unit admission. This is the result of a cohort study examining 869,079 adult women, including 18,715 women with COVID-19, during 12 months up to February 2021.

20 août 2021

Morris J. Israeli data: How can efficacy vs. severe disease be strong when 60% of hospitalized are vaccinated? Covid-19 Data Science 2021, posted 17 August. Full text: https://www.covid-datascience.com/post/israeli-data-how-can-efficacy-vs-severe-disease-be-strong-when-60-of-hospitalized-are-vaccinated

Israël : «Il est important d'utiliser les taux d'infection et de maladie (pour 100 000, par exemple) et non les nombres bruts pour comparer les groupes non vaccinés et vaccinés afin d'évaluer la proportion de vaccinés. L'utilisation de comptes bruts exagère l'efficacité du vaccin lorsque la proportion de vaccins est faible et atténue l'efficacité du vaccin lorsque, comme en Israël, les proportions de vaccins sont élevées. Voir tableau ci-dessous (cliquer dessus pour l'agrandir)

“It is important to use infection and disease rates (per 100k, e.g.) and not raw counts to compare unvaccinated and vaccinated groups to adjust for the proportion vaccinated. Use of raw counts exaggerates the vaccine efficacy when vaccinated proportion is low and attenuates the vaccine efficacy when, like in Israel, vaccines proportions are high.”

Revue de bibliographie quotidienne Covid-19 (archives du 10 juillet 2021 au 26 août 2021)

Tan CW, Chia WN, Young BE, et al. Pan-Sarbecovirus Neutralizing Antibodies in BNT162b2-Immunized SARS-CoV-1 Survivors. N Engl J Med. 2021 Aug 18. PubMed: https://pubmed.gov/34407341. Full text: https://doi.org/10.1056/NEJMoa2108453

Si vous aviez survécu au SRAS-CoV-1 en 2002-2004, le vaccin BioNTech/Pfizer vous donnerait aujourd'hui de puissants anticorps neutralisants "pan-sarbecovirus" croisés. Cette étude (n = 8) est une autre preuve de concept qu'un vaccin pan-coronavirus est possible. Un tel vaccin pourrait couvrir non seulement le SRAS-CoV-2 et ses variantes actuelles et futures, mais également d'autres coronavirus connus pour provoquer des maladies humaines graves.

If you had survived SARS-CoV-1 in 2002-2004, the BioNTech/Pfizer vaccine would today give you potent cross-clade pan-sarbecovirus neutralizing antibodies. This study (n = 8) is another proof of concept that a pan-coronavirus vaccine is possible. Such a vaccine might cover not only SARS-CoV-2 and its current and future variants but also other coronaviruses with known potential to cause severe human diseases.

Mallapaty S. Delta’s rise is fuelled by rampant spread from people who feel fine. Nature 2021, published 19 August. Full text: https://www.nature.com/articles/d41586-021-02259-2

« Les personnes infectées par la variante Delta ne présentent généralement des symptômes de COVID-19 que deux jours après avoir commencé à excréter le coronavirus. »

Ce qui signifie deux jours dangereux de diffuision avant suspicion.

“People infected with the Delta variant generally do not have COVID-19 symptoms until two days after they start shedding the coronavirus.”

Paul LA, Daneman N, Schwartz KL, et al. Association of Age and Pediatric Household Transmission of SARS-CoV-2 Infection. JAMA Pediatr. 2021 Aug 16. PubMed: https://pubmed.gov/34398179. Full text: https://doi.org/10.1001/jamapediatrics.2021.2770

Dans cette étude ontarienne (Canada) de 6 280 familles ayant des cas index pédiatriques, 1 717 (27,3 %) ont subi une transmission secondaire.

«Les jeunes enfants peuvent avoir un risque plus élevé de transmettre le SRAS-CoV-2 à celle et celui qui prennent soin de lui ainsi qu'aux frères et sœurs de la famille que les enfants plus âgés. Dans cette étude de cohorte de 6280 familles avec des cas index pédiatriques, les probabilités ajustées de transmission dans les familles par les enfants âgés de 0 à 3 ans étaient de 1,43 par rapport aux enfants âgés de 14 à 17 ans.

In this Ontario study of 6280 households with pediatric index cases, 1717 households (27.3%) experienced secondary transmission.

“Younger children may have greater risk of transmitting SARS-CoV-2 to caregivers and siblings in the household than older children. In this cohort study of 6280 households with pediatric index cases, the adjusted odds of household transmission by children aged 0 to 3 years was 1.43 compared with children aged 14 to 17 years.”

19 août 2021

Morris J. Israeli data: How can efficacy vs. severe disease be strong when 60% of hospitalized are vaccinated? Covid-19 Data Science 2021, posted 17 August. Full text: https://www.covid-datascience.com/post/israeli-data-how-can-efficacy-vs-severe-disease-be-strong-when-60-of-hospitalized-are-vaccinated

“It is important to use infection and disease rates (per 100k, e.g.) and not raw counts to compare unvaccinated and vaccinated groups to adjust for the proportion vaccinated. Use of raw counts exaggerates the vaccine efficacy when vaccinated proportion is low and attenuates the vaccine efficacy when, like in Israel, vaccines proportions are high.”

France 20210817. Triage in Guadeloupe. La Voix du Nord 2021, published 17 August. Full text: https://www.lavoixdunord.fr/1057833/article/2021-08-17/guadeloupe-le-tri-des-patients-covid-en-reanimation-se-fait-desormais-partir-de

Triage dans un territoire français d'outre-mer. Des articles de presse français indiquent qu'à l'hôpital de Pointe-à-Pitre en Guadeloupe, "les patients de plus de 50 ans et ceux de moins de 50 ans ayant au moins un facteur de comorbidité ne sont plus intubés". Vooir taux d'incidence ci-dessous.

Triage in a French overseas territory. French press reports indicate that at the Pointe-à-Pitre hospital in Guadeloupe, “patients over 50 and those below having at least one comorbid factor are no longer intubated.”

Revue de bibliographie quotidienne Covid-19 (archives du 10 juillet 2021 au 26 août 2021)

Nanduri S, Pilishvili T, Derado G, et al. Effectiveness of Pfizer-BioNTech and Moderna Vaccines in Preventing SARS-CoV-2 Infection Among Nursing Home Residents Before and During Widespread Circulation of the SARS-CoV-2 B.1.617.2 (Delta) Variant — National Healthcare Safety Network, March 1–August 1, 2021. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. ePub: 18 August 2021. DOI: http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm7034e3

USA : « Deux doses de vaccins à ARNm étaient efficaces à 74,7% contre l'infection chez les résidents des maisons de retraite au début du programme de vaccination (mars-mai 2021). De juin à juillet 2021, lorsque la circulation des variantes B.1.617.2 (Delta) prédomina, l'efficacité diminua considérablement pour atteindre 53,1 %. »

“Two doses of mRNA vaccines were 74.7% effective against infection among nursing home residents early in the vaccination program (March–May 2021). During June–July 2021, when B.1.617.2 (Delta) variant circulation predominated, effectiveness declined significantly to 53.1%.”

Schmitz AJ, Turner JS, Liu Z, et al. A vaccine-induced public antibody protects against SARS-CoV-2 and emerging variants. Immunity 2021, published 16 August. Full text: https://doi.org/10.1016/j.immuni.2021.08.013

Les auteurs décrivent un anticorps, surnommé 2C08 (un anticorps monoclonal induit par le vaccin SARS-CoV-2 cloné à partir d'une cellule B du centre germinatif isolée d'un ganglion lymphatique axillaire prélevé sur un adulte en bonne santé après avoir reçu sa deuxième dose d'un vaccin à base d'ARNm) qui neutralise puissamment les souches Delta, Gamma et Alpha et réduit la charge virale pulmonaire et la morbidité chez les hamsters atteints de Delta et Gamma. L'analyse clonale a identifié des clonotypes publics de type 2C08 parmi les cellules B répondant à l'infection ou à la vaccination par le SRAS-CoV-2 chez 41 des 181 individus. En somme : les vaccins contre le SRAS-CoV-2 atténuent la résistance aux variants préoccupants. Dites à vos amis de se faire vacciner.

The authors describe an antibody, dubbed 2C08 (a SARS-CoV-2 vaccine-induced mAb cloned from a germinal center B cell isolated from a draining axillary lymph node sampled from a healthy adult after receiving their second dose of an mRNA-based vaccine) which potently neutralizes the Delta, Gamma and Alpha strains and reduces lung viral load and morbidity in hamsters challenged with Delta and Gamma. Clonal analysis identified 2C08-like public clonotypes among B cells responding to SARS-CoV-2 infection or vaccination in 41 out of 181 individuals. Ergo: SARS-CoV-2 vaccines mitigate resistance by circulating variants of concern. Tell your friends to get vaccinated.

Rizk JG, Gupta A, Sardar P, et al. Clinical Characteristics and Pharmacological Management of COVID-19 Vaccine-Induced Immune Thrombotic Thrombocytopenia With Cerebral Venous Sinus Thrombosis: A Review. JAMA Cardiol. 2021 Aug 10. PubMed: https://pubmed.gov/34374713. Full text: https://doi.org/10.1001/jamacardio.2021.3444

Les recommandations de cette revue : le traitement de la thrombopénie thrombotique immunitaire induite par le vaccin (VITT) doit consister en une anticoagulation thérapeutique principalement avec des substances non-hépariniques et de l'immunoglobine intraveineuse à haute dose (IVIG). Dans les cas graves, l'échange plasmatique doit être utilisé pour éliminer les auto-anticorps. Les transfusions de plaquettes de routine, l'aspirine et la warfarine doivent être évitées en raison du risque d'aggravation de la thrombose et d'amplification du risque de saignement.

The recommendations of this review: treatment of vaccine-induced immune thrombotic thrombocytopenia (VITT) should consist of therapeutic anti-coagulation mostly with non-heparin products and high-dose intravenous immunoglobin (IVIG). In severe cases, plasma exchange should be used for clearing autoantibodies. Routine platelet transfusions, aspirin, and warfarin should be avoided because of the possibility of worsening thrombosis and magnifying risk of bleeding.

Dionne A, Sperotto F, Chamberlain S, et al. Association of Myocarditis With BNT162b2 Messenger RNA COVID-19 Vaccine in a Case Series of Children. JAMA Cardiol. 2021 Aug 10:e213471. PubMed: https://pubmed.gov/34374740. Full text: https://doi.org/10.1001/jamacardio.2021.3471

 Quinze patients (14 patients de sexe masculin [93 %] ; âge médian, 15 ans [extrêmes, 12-18 ans]) ont été hospitalisés pour prise en charge d'une myocardite après avoir reçu le vaccin BNT162b2 (Pfizer). Les symptômes ont débuté  1 à 6 jours après l’injection du vaccin et cinsistaient dans des douleurs thoraciques chez 15 patients (100 %), de la fièvre chez 10 patients (67 %), des myalgies chez 8 patients (53 %) et des céphalées chez 6 patients (40%). Les taux de troponine étaient élevés chez tous les patients à l'admission (médiane, 0,25 ng/mL [0,08-3,15 ng/mL]) et a culminé 0,1 à 2,3 jours après l'admission. A l’examen échocardiographique, une diminution de la fraction d'éjection (FE) ventriculaire gauche (VG) a été constatée chez 3 patients (20 %) et une déformation globale longitudinale ou circonférentielle anormale était présente chez 5 patients (33%). Aucun patient n'avait d'épanchement péricardique. IRM : les résultats de l'imagerie par résonance étaient en faveur d’une myocardite chez 13 patients (87 %). Aucun patient requis une admission en unité de soins intensifs et la durée médiane du séjour à l'hôpital a été de 2 jours (1-5). Au suivi, 1 à 13 jours après la sortie de l'hôpital, 11 patients (73 %) ont présentaient une résolution des symptômes. Un patient (7 %) présentait une fonction systolique VG basse limite persistante à l'échocardiogramme (FE 54 %). Les taux de troponine sont restés légèrement élevés chez 3 patients (20 %). Un patient (7 %) a présenté une tachycardie ventriculaire non soutenue sur l’enregistrement ambulatoire.

A case series of 15 children who were hospitalized with myocarditis after receiving the BioNTech/Pfizer vaccine.

18 août 2021

Liu Y, Liu J, Bryan AJ, et al. Delta spike P681R mutation enhances SARS-CoV-2 fitness over Alpha variant. bioRxiv 2021, posted 12 August. Full text: https://doi.org/10.1101/2021.08.12.456173

La mutation P681R sur la protéine Spike du Delta pourrait être une mutation clé dans l'amélioration de la réplication du variant Delta via un clivage S1/S2 accru. Les auteurs suggèrent que les mutations Spike qui affectent potentiellement l'efficacité du clivage de la furine devraient être étroitement observées pour la surveillance future des variantes.

The Delta spike mutation P681R could be a key mutation in enhancing Delta variant replication via increased S1/S2 cleavage. The authors suggest that Spike mutations that potentially affect furin cleavage efficiency should be closely monitored for future variant surveillance.

Wadman M. A grim warning from Israel: Vaccination blunts, but does not defeat Delta. Science 2021, published 16 August. Full text: https://www.sciencemag.org/news/2021/08/grim-warning-israel-vaccination-blunts-does-not-defeat-delta

Un avertissement inquiétant nous vient d'Israël : la vaccination émousse, mais n'élimine pas le Delta. « Israël, qui a précédé le monde dans le lancement des vaccinations et dans la collecte de données, est confronté à une vague de cas de COVID-19 qui, selon les autorités, poussera les hôpitaux au bord du gouffre. Près de 60 % des patients gravement malades sont complètement vaccinés.

“Israel, which has led the world in launching vaccinations and in data gathering, is confronting a surge of COVID-19 cases that officials expect to push hospitals to the brink. Nearly 60% of gravely ill patients are fully vaccinated.”

Lloyd-Sherlock P, Lasco G, McKee M, Perianayagam A, Sempé L. Does vaccine ageism amount to gerontocide? Lancet. 2021 Aug 11:S0140-6736(21)01689-5. PubMed: https://pubmed.gov/34390657. Full text: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)01689-5

L'âgisme vaccinal équivaut-il à un gérontocide ? 

«En Inde, plus de personnes de moins de 45 ans sont vaccinées que celles de 60 ans ou plus, même si environ la moitié de ces 60 ans ou plus n'ont pas encore reçu ne serait-ce qu'une seule dose. Contrairement au triage basé sur l'âge pour les soins aigus liés au COVID-19, cette politique de vaccination ne sauvera pas de vies : elle contribuera à des milliers, voire des millions de décès évitables. Aux Philippines, où seulement 8,5% des personnes de 60 ans ou plus avaient été complètement vaccinées au 29 juin 2021, l'accent de la vaccination s'est maintenant déplacé vers les jeunes adultes dits en âge de travailler.

“In India, more people younger than 45 years are being vaccinated than those 60 years or older, even though about half of those 60 years or older are yet to receive even a single dose. Unlike age-based triage for acute COVID-19 care, this vaccination policy will not save lives: it will contribute to thousands, potentially millions of avertable deaths. In the Philippines, where only 8·5% of people 60 years or older had been fully vaccinated as of June 29, 2021, the focus of vaccination has now shifted to younger so-called working age adults.”

 

Subbaraman N. How do vaccinated people spread Delta? What the science says. Nature 2021, published 12 August. Full text: https://www.nature.com/articles/d41586-021-02187-1

Le delta semble être plus susceptible que d'autres variants de se propager via des personnes vaccinées. Bien que les personnes vaccinées soient probablement contagieuses pendant une période plus courte, elles doivent prendre des précautions, en particulier en intérieur. 

The Delta seems to be more likely than other variants to spread via vaccinated people. Although vaccinated people are probably infectious for a shorter period, they need to take precautions, especially in indoor settings. If you cannot avoid crowded indoor settings, see here: CDC 20210406. Improve How Your Mask Protects You. Centers for Disease Control 2021 (updated 6 April, accessed 15 August). Full text: https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/your-health/effective-masks.html

Liu T, Wu D, Yan W, et al. Twelve-month systemic consequences of COVID-19 in patients discharged from hospital: a prospective cohort study in Wuhan, China. Clin Infect Dis. 2021 Aug 14:ciab703. PubMed: https://pubmed.gov/34390330. Full text: https://doi.org/10.1093/cid/ciab703

La vie des survivants de la COVID-19 n'est pas facile, comme le montre ce suivi de 12 mois de 594 survivants du COVID-19 sortis de l'hôpital Tongji à Wuhan du 10 février au 30 avril 2020. Après 3, 6 et 12 mois, 257 (51,2%), 169 (40,0%) et 138 (28,4%) patients présentaient au moins un symptôme. Environ 5 % des patients présentaient une altération de la fonction pulmonaire à 12 mois. Des anomalies à l'électrocardiogramme sont présentes chez 256 (51,0 %) patientes  3 mois après la sortie, incluant arythmie, changement ST-T et bloc de conduction, qui ont augmenté à 258 (61,1 %) cas lors de la visite à 6 mois et se sont maintenues à une fréquence élevée, (242 ; 49,8 %) étant retrouvées lors de la visite à 12 mois. Une incidence accrue d'anomalies des fonctions hépatique et rénale a également été observée. Les patients ont un âge médian de 63 ans, ont été sévèrement ou gravement malades à l'origine (88,1 %), dont 36,1 % avaient des antécédents de tabagisme, et au moins une comorbidité préexistante était fréquente.

The lives of COVID-19 survivors is not easy, as shown by this 12-month follow up of 594 COVID-19 survivors discharged from Tongji Hospital in Wuhan from February 10 to April 30, 2020. After 3, 6 and 12 months, 257 (51.2%), 169 (40.0%) and 138 (28.4%) patients had at least one symptom. About 5% of patients had restrictions in pulmonary function at 12 months. Electrocardiogram abnormalities occurred in 256 (51.0%) patients at 3 months post-discharge, including arrhythmia, ST-T change and conduction block, which increased to 258 (61.1%) cases at the 6-month visit and were maintained at a high frequency (242; 49.8%) at the 12-month visit. An increased incidence of abnormal liver and renal function was also found. Patients had a median age of 63, had been severe or critically ill originally (88.1%), 36.1% of whom had a history of smoking, and having at least one pre-existing co-morbidity was common.

17 août 2021

Diaz GA, Parsons GT, Gering SK, Meier AR, Hutchinson IV, Robicsek A. Myocarditis and Pericarditis After Vaccination for COVID-19. JAMA. 2021 Aug 4. PubMed: https://pubmed.gov/34347001. Full text: https://doi.org/10.1001/jama.2021.13443

Parmi 2 000 287 personnes ayant reçu au moins 1 vaccination COVID-19 (BioNTech/Pfizer : 52,6 %, Moderna : 44,1 %, Johnson & Johnson : 3,1 %), 20 personnes ont présenté une myocardite liée au vaccin (1 pour 100 000) et 37 une péricardite (1,8 pour 100 000). La myocardite est survenue en moyenne 3,5 jours après la vaccination. Quinze individus (75 %) étaient des hommes. Quatre personnes (20 %) ont développé des symptômes après la première vaccination et 16 (80 %) après la seconde. Dix-neuf patients (95%) ont été admis à l'hôpital. Tous sont sortis après une médiane de 2 jours. Il n'y a eu ni réadmission ni décès. Vous trouverez plus de détails sur la péricardite dans l'article intégral dont je fournis ici l'adresse du fait de son importance dans le débat actuel autour de la dangerosité des vaccinations.

https://cloud.leviia.com/s/2Q4r5NR5zqonxWD

Among 2,000,287 individuals receiving at least 1 COVID-19 vaccination (BioNTech/Pfizer: 52.6%, Moderna: 44.1%, Johnson & Johnson: 3.1%), 20 individuals had vaccine-related myocarditis (1 per 100,000) and 37 had pericarditis (1.8 per 100,000). Myocarditis occurred a median of 3.5 days after vaccination. Fifteen individuals (75%) were male. Four persons (20%) developed symptoms after the first vaccination and 16 (80%) after the second one. Nineteen patients (95%) were admitted to the hospital. All were discharged after a median of 2 days. There were no readmissions or deaths. Find more details about pericarditis in the article.

 

FDA 20210812. Coronavirus (COVID-19) Update: FDA Authorizes Additional Vaccine Dose for Certain Immunocompromised Individuals. FDA 2021, published 12 August. Full text: https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/coronavirus-covid-19-update-fda-authorizes-additional-vaccine-dose-certain-immunocompromised

La FDA autorise une troisième dose de rappel chez les personnes ayant subi une transplantation d'organe solide ou celles qui ont un niveau équivalent d'immunodépression. Le communiqué de presse du 12 juillet 2021 indique également que « les patients doivent être conseillés de maintenir des mesures barrières pour aider à prévenir la COVID-19. De plus, les personnes en contact étroit avec des personnes immunodéprimées devraient se faire vacciner, en fonction de leur état de santé, pour offrir une protection accrue à leurs proches. »

The FDA allows a third booster dose in individuals with solid organ transplant or those who have an equivalent level of immunocompromise. The news release also states that “patients should be counseled to maintain physical precautions to help prevent COVID-19. In addition, close contacts of immunocompromised persons should get vaccinated, as appropriate for their health status, to provide increased protection to their loved ones.”

Read JM, Green CA, Harrison EM, et al. Hospital-acquired SARS-CoV-2 infection in the UK’s first COVID-19 pandemic wave. Lancet 20212, published 12 August. Full text: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)01786-4

Jusqu'à fin juillet 2020, 6,8% des patients atteints de COVID-19 dans 314 hôpitaux britanniques pourraient avoir été infectés après une admission en hospitalisation, avec un pic de 8,2% à la mi-mai. Les auteurs concluent: « Comme le SRAS-CoV-2 est susceptible de persister en tant que virus endémique ou saisonnier dans les années à venir, il est essentiel d'utiliser les leçons apprises jusqu'à présent dans la pandémie pour minimiser le fardeau des infections nosocomiales. »

Until the end of July 2020, 6.8% of patients with COVID-19 in 314 UK hospitals may have been infected after hospital admission, with a peak of 8.2% in mid-May. The authors conclusion, “As SARS-CoV-2 is likely to persist as an endemic or seasonal virus in coming years, it is critical to use the lessons learned so far in the pandemic to minimise the burden of hospital-acquired infections.”

16 août 2021

Hillus D, Schwarz T, Tober-Lau P, et al. Safety, reactogenicity, and immunogenicity of homologous and heterologous prime-boost immunisation with ChAdOx1 nCoV-19 and BNT162b2: a prospective cohort study. Lancet Respir Dis 2021, published 12 August. Full text: https://doi.org/10.1016/S2213-2600(21)00357-X

Une nouvelle étude prospective de vaccins comparant « AstraZeneca (AZ) + BioNTech/Pfizer (BP) » avec 2 fois AZ et 2 fois BP. Les auteurs montrent que l'administration d'AZ d'abord et de BP ensuite a provoqué une réponse immunitaire plus forte que deux doses de l'un ou l'autre des vaccins. Ces données pourraient-elles stimuler une renaissance du vaccin AstraZeneca ? Pas certain. La différence pourrait s'expliquer par l'intervalle d'immunisation plus long (et peut-être plus efficace) d'AZ+BP par rapport à l'intervalle typique de 3 semaines des deux injections de BP.

A new prospective vaccine mixing study comparing “AstraZeneca (AZ) + BioNTech/Pfizer (BP)” with 2 x AZ and 2 x BP. The authors show “AZ first, BP second” elicited a stronger immune response than two doses of either vaccine. Could these data spur a renaissance for the AstraZeneca vaccine? Not sure. The difference might be explained by the longer (and possibly more effective) immunization interval of AZ+BP compared to the typical 3-week interval of the two BP injections.

OHA 20210805. COVID-19 Monthly Report | Oregon’s Weekly Surveillance Summary. Oregon Health Authority 2021, published 5 August. Full text: https://www.oregon.gov/oha/covid19/Documents/DataReports/Breakthrough-Report-08-2021.pdf

En Oregon (États-Unis), le début de la 4e vague de la pandémie est celui de non vaccinés. En juillet 2021, 81 % des 12 514 cas de COVID-19 concernaient des personnes non vaccinées, tout comme 82 % des décès liés au COVID-19. Conclusion : « Bien que le nombre de cas de COVID-19 malgré la vaccination augmente, ils sont très faibles par rapport aux plus de 2,3 millions de personnes qui ont effectué leur vaccination complète contre le COVID-19. » Voir courbes ci-dessous.

In Oregon (US), the beginning of the 4th wave of the pandemic is that it is a wave of the unvaccinated. In July 2021, 81% of 12,514 COVID-19 cases were among unvaccinated people, as were 82% of COVID-19-related deaths. Conclusion: “Although the number of vaccine breakthrough cases is increasing, they are very small when compared to the more than 2.3 million people who have completed their COVID-19 vaccination.”

Revue de bibliographie quotidienne Covid-19 (archives du 10 juillet 2021 au 26 août 2021)

Leatherby L. See How Vaccines Can Make the Difference in Delta Variant’s Impact. The New York Times 2021, published 12 August. Infographic: https://www.nytimes.com/interactive/2021/08/12/science/covid-delta-breakthrough.html

À mesure que le nombre de personnes vaccinées augmente, le nombre de cas de covid malgré vaccination augmentera également. Cela ne veut pas dire que nos vaccins sont inefficaces. En modélisant les épidémies de COVID induites par Delta dans deux communautés, l'une avec un taux de vaccination élevé et l'autre avec un faible taux, les niveaux de maladie grave et de décès étaient très différents.

As the number of vaccinated people increases, so will the number of breakthrough cases. This doesn’t mean that our vaccines are ineffective. See this very instructional infographic which modeled Delta-driven COVID outbreaks in two communities, one with a high vaccination rate and another with a low rate. Their levels of serious illness and death were starkly different.

15 août 2021

Rozier G. Guadeloupe. CovidTracker 2021, update 13 August. Web page: https://covidtracker.fr/dashboard-departements/?dep=971

La Guadeloupe - et dans une moindre mesure l'île sœur La Martinique - sont une image révélatrice du variant Delta entrant dans une population où moins de 20% ont reçu leur première injection de vaccin COVID-19. Pour la semaine du 4 au 10 août, l'incidence cumulée chez les jeunes adultes de 20 à 29 ans était de… 4248 ! Pour la Guadeloupe et la Martinique, les spécialistes du tourisme prévoient une baisse de la fréquentation à la prochaine haute saison (décembre 2021 – avril 2021).

Voir ci-dessous le tableau indiquant le nombre de cas en fonction de la date et de l'âge.

Guadeloupe – and to a lesser extent the sister island Martinique (see Google Maps) – are a telling picture of the Delta variant entering a population where less than 20% had their first COVID-19 vaccine shot. For the week 4-10 August, the cumulative incidence in young adults aged 20 to 29 years was… 4248! For Guadeloupe and Martinique, tourism specialists predict a decline in visitor numbers in the next high season (December 2021 – April 2021).

Revue de bibliographie quotidienne Covid-19 (archives du 10 juillet 2021 au 26 août 2021)

Yong E. How the Pandemic Now Ends. The Atlantic 2021, published 12 August. Full text: https://www.theatlantic.com/health/archive/2021/08/delta-has-changed-pandemic-endgame/619726/

 Voici donc le dilemme actuel de la pandémie : les vaccins restent le meilleur moyen pour les individus de se protéger, mais les sociétés ne peuvent pas envisager les vaccins comme leur seule défense. Et pour l'instant, les zones non vaccinées sont encore assez grandes pour supporter les surtensions Delta, qui peuvent submerger les hôpitaux, fermer les écoles et créer plus de chances que des variantes encore pires émergent. 

Just one of several excellent citations: “Here, then, is the current pandemic dilemma: Vaccines remain the best way for individuals to protect themselves, but societies cannot treat vaccines as their only defense. And for now, unvaccinated pockets are still large enough to sustain Delta surges, which can overwhelm hospitals, shut down schools, and create more chances for even worse variants to emerge.”

Sah P, Fitzpatrick MC, Zimmer CF, et al. Asymptomatic SARS-CoV-2 infection: A systematic review and meta-analysis. Proc Natl Acad Sci U S A. 2021 Aug 24;118(34):e2109229118. PubMed: https://pubmed.gov/34376550. Full text: https://doi.org/10.1073/pnas.2109229118

Revue systématique et méta-analyse de plus de 350 articles. Les auteurs estiment que plus d'un tiers des infections sont véritablement asymptomatiques, avec un plus grand pourcentage chez les enfants (46,7%) par rapport aux personnes âgées (19,7%) et de même  chez les personnes sans pathologie médicale sous-jacente par rapport à celles qui avaient des comorbidités.

Systematic review and meta-analysis of over 350 papers. The authors estimate that more than one-third of infections are truly asymptomatic, with greater asymptomaticity in children (46.7%) compared with the elderly (19.7%), and greater asymptomaticity among people with no underlying medical conditions compared with those who had comorbidities.

 

14 août 2021

Pavord S, Scully M, Hunt BJ, et al. Clinical Features of Vaccine-Induced Immune Thrombocytopenia and Thrombosis. N Engl J Med. 2021 Aug 11. PubMed: https://pubmed.gov/34379914. Full text: https://doi.org/10.1056/NEJMoa2109908

La mortalité associée à la thrombopénie et à la thrombose immunitaires induites par le vaccin (VITT) au Royaume -Uni (AstraZeneca, vaccin à adénovirus) était la plus élevée chez les patients présentant une faible numération plaquettaire et une hémorragie intracrânienne. Une étude prospective sur170 cas prouvés et de 50 cas probables de VITT au Royaume-Uni, du 22 mars au 6 juin 2021. La mortalité globale était de 22%, mais de 73% chez les patients avec une numération plaquettaire < 30 000 et une hémorragie intracrânienne.

The mortality associated with vaccine-induced immune thrombocytopenia and thrombosis (VITT) was highest among patients with a low platelet count and intracranial hemorrhage. A prospective study of 170 definite and 50 probable cases of VITT (UK, 22 March – 6 June 2021). The overall mortality was 22%, but 73% among patients with platelet counts < 30,000 and intracranial hemorrhage.

 

Baraniuk C. Covid-19: How effective are vaccines against the delta variant? BMJ. 2021 Aug 9;374:n1960. PubMed: https://pubmed.gov/34373255. Full text: https://doi.org/10.1136/bmj.n1960

49% des personnes au Royaume-Uni décédées d'une infection par le variante SARS-CoV-2 Delta jusqu'au 19 juillet 2021 avaient reçu deux doses de vaccin. Pfizer travaille sur une version mise à jour de son vaccin, ciblant spécifiquement le variant delta (phrase extraite du texte complet).

49% of people in the UK who died from infection with the SARS-CoV-2 Delta variant up until 19 July had had two vaccine doses – the author is confident about the protection offered by current vaccines. (He’s probably right!)

 

Malard F, Gaugler B, Gozlan J, et al. Weak immunogenicity of SARS-CoV-2 vaccine in patients with hematologic malignancies. Blood Cancer J. 11, 142 (2021). https://doi.org/10.1038/s41408-021-00534-z

Chez les patients atteints d'hémopathies malignes, la vaccination avec deux doses du vaccin BioNTech/Pfizer se traduit par une augmentation significative de la réponse humorale, permettant à près de la moitié des patients d'obtenir une protection immunitaire contre la COVID-19 (étude rétrospective, n = 237). L'utilisation d'un traitement ciblant les lymphocytes B au cours des 12 mois précédant la vaccination et un faible taux de lymphocytes B CD19+ prédisaient l'échec de l'obtention d'une protection immunitaire.

In patients with hematological malignancies, vaccination with two doses of the BioNTech/Pfizer vaccine translates into a significant increase in humoral response, allowing almost half of the patients to achieve immune protection against COVID-19 (retrospective study, n = 237). The use of B cell targeting treatment within the previous 12 months before vaccination, and a low CD19+ B cell level predicted failure in achieving immune protection.

Pegu A, O’Connell S, Schmidt SD, et al. Durability of mRNA-1273-induced antibodies against SARS-CoV-2 variants. Science 2021, published 12 PubMed: https://pubmed.gov/34031659. Full text: https://doi.org/10.1126/science.abj4176

La plupart des personnes vaccinées avec le vaccin Moderna ont conservé des anticorps  fonctionnels contre les variants du SRAS-CoV-2 pendant 6 mois, notamment Alpha, Beta, Gamma, B.1.429 (Californie) et B.1.526 (New York). Les réponses neutralisantes étaient rares après une seule dose de Moderna, mais au pic de la réponse à la deuxième dose, tous les individus avaient des réponses robustes à toutes les variants. L'étude comprenait les résultats de 8 volontaires dans chacun des trois groupes d'âge : 18-55, 55-70 et 71+ ans.

Most individuals vaccinated with the Moderna vaccine maintained binding and functional antibodies against SARS-CoV-2 variants for 6 months, including Alpha, Beta, Gamma, B.1.429, and B.1.526. Neutralizing responses were rare after a single Moderna dose, but at the peak of response to the second dose, all individuals had robust responses to all variants. The study included the results from 8 volunteers in each of three age groups: 18-55, 55-70, and 71+ years of age.

Ali K, Berman G, Zhou H, et al. Evaluation of mRNA-1273 SARS-CoV-2 Vaccine in Adolescents. N Engl J Med. 2021 Aug 11. PubMed: https://pubmed.gov/34379915. Full text: https://doi.org/10.1056/NEJMoa2109522

Rien de vraiment nouveau : le vaccin Moderna avait un profil d'innocuité acceptable chez les adolescents, la réponse immunitaire étant similaire à celle des jeunes adultes et le vaccin ayant empêché la survenue de la  COVID-19. Fait intéressant, dans le groupe placebo, après les première et deuxième injections, les participants à l'étude ont ressenti une douleur au site d'injection (chez 34,8 % et 30,3 %, respectivement), des céphalées (chez 38,5 % et 30,2 %, respectivement) et de la fatigue (chez 36,6 % et 28,9 %, respectivement). Il est intéressant de constater à quel point la simple idée de recevoir un vaccin qui pourrait vous donner des maux de tête ou de la fatigue donne… une fatigue des maux de tête. 

Nothing truly new: the Moderna vaccine had an acceptable safety profile in adolescents, the immune response was similar to that in young adults, and the vaccine prevented COVID-19. Interestingly, in the placebo group, after the first and second injections, study participants experienced injection-site pain (in 34.8% and 30.3%, respectively), headache (in 38.5% and 30.2%, respectively), and fatigue (in 36.6% and 28.9%, respectively). It’s fascinating how just the thought of getting a vaccine that might give you headache or fatigue is sufficient to give you… headache fatigue. In this trial, about half of all mild adverse events were probably the product of human imagination.

13 août 2021

Jeffey N. Among older Israelis, serious COVID rate six times as high if unvaccinated. The Times of Israel 2021, published 10 August. Full text: https://www.timesofisrael.com/among-older-israelis-serious-covid-rate-six-times-higher-if-unvaccinated/

Dans la nouvelle vague épidémique en Israël, le nombre de cas graves de COVID-19 est beaucoup plus élevé chez les personnes vaccinées, jeunes et moins jeunes.

In the new epidemic wave in Israel, the number of severe COVID-19 cases is far higher among vaccinated people, both old and young.

Revue de bibliographie quotidienne Covid-19 (archives du 10 juillet 2021 au 26 août 2021)

Van Vinh Chau N, Ngoc NM. Transmission of SARS-CoV-2 Delta Variant Among Vaccinated Healthcare Workers, Vietnam. Lancet Preprints 2021, posted 10 August.

Dans cette étude portant sur 62 professionnels de la santé, les infections avec le variant Delta étaient associées à des charges virales élevées (251 fois plus élevées que chez les personnes infectées par des souches historiques), à une positivité PCR prolongée (8 à 33 jours ; médiane : 21) et à de faibles niveaux d'anticorps neutralisants induits par le vaccin. Les auteurs concluent que les mesures de distanciation physique seront essentielles pour réduire la transmission de la variante Delta.

In this study of 62 healthcare workers, breakthrough infections with the Delta variant were associated with high viral loads (251 times higher than in people infected with historical strains), prolonged PCR positivity (8–33 days; median: 21), and low levels of vaccine-induced neutralizing antibodies. The authors conclude that physical distancing measures will be critical to reduce the transmission of the Delta variant.

12 août 2021

Puranik A, Lenehan PJ, Silvert E, et al. Comparison of two highly-effective mRNA vaccines for COVID-19 during periods of Alpha and Delta variant prevalence. medRxiv 2021, posted 9 August. Full text: https://doi.org/10.1101/2021.08.06.21261707

Les données du Mayo Clinic Health System de janvier à juillet 2021 révèlent que les vaccins à ARNm produits par BioNTech/Pfizer et Moderna sont très efficaces contre l'infection par le SARS-CoV-2 (BioNTech/Pfizer : 76% ; Moderna : 86%) et les hospitalisations associées (85 % vs 91,6 %). Surprise en juillet : alors que l'efficacité du vaccin contre l'hospitalisation est restée élevée (75 % contre 81 %), l'efficacité contre l'infection a été plus faible pour les deux vaccins (42 % contre 76 %), avec une réduction plus prononcée pour le vaccin BioNTech/Pfizer. A prendre avec un grain de sel. (Vaccin BioNTech/Pfizer administré plus tôt que le vaccin Moderna ?) Notez qu'il s'agit d'un document pré-imprimé qui n'a pas encore été examiné.

Data from the Mayo Clinic Health System from January to July 2021 find that the mRNA vaccines produced by BioNTech/Pfizer and Moderna are highly effective against SARS-CoV-2 infection (BioNTech/Pfizer: 76%; Moderna: 86%) and COVID-19 associated hospitalization (85% vs. 91.6%). Surprise in July: while vaccine effectiveness against hospitalization remained high (75% vs 81%), effectiveness against infection was lower for both vaccines (42% vs 76%), with a more pronounced reduction for the BioNTech/Pfizer vaccine. To be taken with a grain of salt. (BioNTech/Pfizer vaccine administered earlier than the Moderna vaccine?) Note that this is a pre-print paper that has not yet been reviewed.

Rocklöv J, Liu Y. The reproductive number of the Delta variant of SARS-CoV-2 is far higher compared to the ancestral SARS-CoV-2 virus. J Travel Med 2021, published 9 August. Full text: https://doi.org/10.1093/jtm/taab124

Ne jetez pas vos masques, même si vous êtes vacciné. Ici, les auteurs résument 5 études qui estiment le nombre reproducteur de base pour le variant Delta allant de 3,2 à 8, avec une moyenne de 5,08. C'est presque le double du R0 de la souche historique qui est de 2,79. La vaccination à elle seule pourrait ne pas suffire jusqu'en 2022.

Don’t throw your masks away, even if you are vaccinated. Here, the authors summarize 5 studies that estimate the basic reproductive number for the Delta variant ranging from 3.2 to 8, with a mean of 5.08. This is almost double the R0 of the historical strain which is 2.79. Vaccination alone may not be sufficient until well into 2022.

11 août 2021

Moline HL, Whitaker M, Deng L, et al. Effectiveness of COVID-19 Vaccines in Preventing Hospitalization Among Adults Aged ≥65 Years — COVID-NET, 13 States, February–April 2021. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. ePub: 6 August 2021. DOI: http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm7032e3

Chez les adultes 65 ans, l'efficacité de la vaccination complète pour prévenir l'hospitalisation était de 96 % pour les vaccins BioNTech/Pfizer et Moderna (exception : 91 % pour le vaccin BioNTech/Pfizer chez les 75 ans et plus) et de 84 % pour le vaccin Janssen. Noter que ces données datent de "l'ère pré-Delta".

Among adults aged ≥ 65, the effectiveness of full vaccination for preventing hospitalization was 96% for the BioNTech/Pfizer and Moderna vaccines (exception: 91% for the BioNTech/Pfizer vaccine in age ≥ 75 years) and 84% for the Janssen vaccine. Note that these data are from the pre-Delta era.

Nirenberg E. Myocarditis and COVID-19 mRNA vaccines. Deplatformdisease.com 2021, published 10 July. https://www.deplatformdisease.com/blog/myocarditis-and-covid-19-mrna-vaccines?format=amp

Ce n'est pas un article scientifique, mais ça vaut le coup d'être lu. L'auteur mentionne que par rapport à la myocardite induite par le vaccin à ARNm, laisser les enfants sans protection ou incomplètement protégés contre COVID-19 fait courir actuellement le plus grand risque.

Not a scientific paper, but worth reading. The author mentions that compared to mRNA vaccine-induced myocarditis, leaving children unprotected or incompletely protected from COVID-19 is currently the bigger risk.

Pepe S, Gregory AT, Denniss AR. Myocarditis, Pericarditis and Cardiomyopathy After COVID-19 Vaccination. Heart Lung Circ. 2021 Jul 30:S1443-9506(21)01156-2. PubMed: https://pubmed.gov/34340927. Full text: https://doi.org/10.1016/j.hlc.2021.07.011

Parmi 2 000 287 personnes ayant reçu au moins une dose de vaccin, 20 ont présenté une myocardite liée au vaccin (1,0/100 000 ; âge médian : 36) et 37 avaient une péricardite (1,8/100 000 ; âge médian : 59). La myocardite est survenue en médiane 3,5 jours après la vaccination, la péricardite s'est développée après une médiane de 20 jours. Tous les patients sont sortis après un délai médian de 1 à 2 jours. Aucun décès.

Among 2,000,287 individuals receiving at least one dose of vaccine, 20 had vaccine-related myocarditis (1.0/100,000; median age: 36) and 37 had pericarditis (1.8/100,000; median age: 59). Myocarditis occurred a median of 3.5 days after vaccination, pericarditis developed after a median of 20 days. All patients were discharged after a median of 1 to 2 days. No one died.

Kidman R. Use HIV’s lessons to help children orphaned by COVID-19. Nature 2021, published 9 August. Full text: https://www.nature.com/articles/d41586-021-02155-9

« Les jeunes qui ont perdu leurs parents à cause de la pandémie ont besoin d'un soutien urgent et d'un suivi à long terme pour éviter la cascade d'adversité qui peut s'ensuivre. Des décennies de recherche sur l'épidémie d'HIV fournissent une base solide."

“Young people who have lost parents to the pandemic need urgent support and long-term study to avert the cascade of adversity that can follow. Decades of research into the HIV epidemic provide(s) a solid foundation.”

10 août 2021

Perkins G, Bronwen CJ, Connolly BA, et al. An adaptive randomized controlled trial of non-invasive respiratory strategies in acute respiratory failure patients with COVID-19. medRxiv 2021, posted 4 August. Full text: https://doi.org/10.1101/2021.08.02.21261379

Sur 13 mois, 1272 participants ont été randomisés pour recevoir une ventilation en pression positive continue (CPAP ; n = 380, 29,9 %), une oxygénation nasale à haut débit (HFNO ; n = 417, 32,8 %) et une oxygénothérapie conventionnelle (n = 475, 37,3 % ). Ni CPAP ni HFNO, comparés à l'oxygénothérapie conventionnelle, n'ont réduit la mortalité.

Dans un commentaire d'Elisabeth Mahase (Covid-19 : la CPAP réduit le besoin de ventilation mécanique invasive chez les patients nécessitant de l'oxygène, selon une étude. BMJ. 4 août 2021 ; 374 : n1950. PubMed : https://pubmed.gov/34353810. Texte intégral : https://doi.org/10.1136/bmj.n1950), le chercheur en chef de l'étude, Danny McAuley, est cité, déclarant que la « CPAP réduit la pression sur le besoin de ventilation mécanique invasive et la pression sur les lits des unités de soins intensifs. L'HFNO utilise une grande quantité d'oxygène et peut causer des problèmes avec une ressource limitée, et nous avons constaté qu'elle ne produit rien de plus que la thérapie conventionnelle.

Over 13 months, 1272 participants were randomized to continuous positive airway pressure (CPAP; n = 380, 29.9%), high-flow nasal oxygenation (HFNO; n = 417, 32.8%) and conventional oxygen therapy (n = 475, 37.3%). Neither CPAP nor HFNO, when compared with conventional oxygen therapy, reduced mortality at any point. In a comment by Elisabeth Mahase (Covid-19: CPAP reduces need for invasive mechanical ventilation in patients requiring oxygen, study finds. BMJ. 2021 Aug 4;374:n1950. PubMed: https://pubmed.gov/34353810. Full text: https://doi.org/10.1136/bmj.n1950), the study’s chief investigator Danny McAuley is cited, saying that “CPAP reduces the pressure on the need for invasive mechanical ventilation and the pressure on intensive care unit beds. HFNO uses a large amount of oxygen and can cause issues with limited oxygen therapy, and we’ve found that it doesn’t really add anything above conventional therapy.”

Bitan DT, Kridin K, Cohen AD, Weinstein O. COVID-19 hospitalisation, mortality, vaccination, and postvaccination trends among people with schizophrenia in Israel: a longitudinal cohort study. Lancet Psychiatry 2021, published 5 August. Full text: https://doi.org/10.1016/S2215-0366(21)00256-X

Une étude de cohorte longitudinale avec une estimation sur un an des différences d'hospitalisation et de mortalité chez 25 539 patients atteints de schizophrénie et 25 539 témoins. Les personnes atteintes de schizophrénie ont montré un risque plus élevé d'hospitalisation pour COVID-19 (rapport de risque [HR] 4,81) et de mortalité (HR 2,52) et ont montré une baisse plus marquée de la survie au fil du temps. Le diabète, l'hypertension, l'obésité et les cardiopathies ischémiques étaient des prédicteurs significatifs des taux de vaccination chez les patients atteints de schizophrénie, mais pas chez les témoins. Voir aussi le commentaire de De Picker LJ. Combler les lacunes en matière de mortalité, de vaccination et de preuves liées au COVID-19 pour les personnes atteintes de maladie mentale grave. Lancet Psychiatry 2021, publié le 5 août. Texte intégral : https://doi.org/10.1016/S2215-0366(21)00291-1

 

A longitudinal cohort study with a year-long estimation of differences in hospitalization and mortality among 25,539 patients with schizophrenia and 25,539 controls. People with schizophrenia showed a higher risk for COVID-19 hospitalization (hazard ratio [HR] 4.81) and mortality (HR 2.52) and showed a sharper decline in survival as time progressed. Diabetes, hypertension, obesity, and ischemic heart disease were significant predictors of vaccination rates among patients with schizophrenia but not among controls. See also the comment by De Picker LJ. Closing COVID-19 mortality, vaccination, and evidence gaps for those with severe mental illness. Lancet Psychiatry 2021, published 5 August. Full text: https://doi.org/10.1016/S2215-0366(21)00291-1

 

Chauhan K, Soni D, Sarkar D, et al. Mucormycosis after COVID-19 in a patient with diabetes. Lancet 2021, published 4 August. Full text: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)01641-X

Dix jours après un traitement incluant oxygénothérapie, des antibiotiques intraveineux et des corticostéroïdes en raison d'une pneumonie modérément sévère causée par le SRAS-CoV-2, ce patient se présente avec une tache noirâtre - s'étendant juste en dessous de son œil gauche jusqu'au côté gauche de sa face au niveau de sa bouche—qui était apparue 2 jours plus tôt. Les auteurs expliquent que la « COVID-19 suivie d'une mucormycose entraîne un taux de mortalité très élevé nécessitant une détection rapide, un traitement antifongique et un débridement chirurgical agressif qui restent des facteurs clés dans la thérapeutique ». Voir aussi la vidéo ci-dessous.

Ten days after starting a treatment with supplemental oxygen, intravenous antibiotics, and corticosteroids due to a moderately severe pneumonia caused by SARS-CoV-2, this patient presents with a blackish patch—extending from just below his left eye to the left side of his face to the level of his mouth—that had developed 2 days earlier. The authors explain that “COVID-19 followed by mucormycosis carries a very high mortality rate and timely detection, antifungal therapy, and aggressive surgical debridement remain key factors in the management.” See also the video at https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(21)01641-X/fulltext#sec1

9 août 2021

Perry RJ, Tamborska A, Bhagteshwar S, et al. Cerebral venous thrombosis after vaccination against COVID-19 in the UK: a multicentre cohort study. Lancet 2021, published 6 August. Full text: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)01608-1

Une analyse de 95 patients de plus de 40 hôpitaux à travers le Royaume-Uni. Soixante-dix patients avaient une thrombopénie thrombotique immunitaire induite par le vaccin (VITT) et 25 n'en avaient pas. Les patients atteints de thrombose veineuse cérébrale associée au VITT avaient plus de veines intracrâniennes thrombosées que les patients non-VITT ; ils avaient aussi plus fréquemment une thrombose extracrânienne. Le décès ou la dépendance sont survenus chez 47 % des patients atteints de thrombose veineuse cérébrale associée au VITT. Les anticoagulants non hépariniques et le traitement par immunoglobulines pourraient améliorer les résultats du VITT.

An analysis of 95 patients from more than 40 hospitals across the UK. Seventy patients had vaccine-induced immune thrombotic thrombocytopenia (VITT) and 25 did not. Patients with VITT-associated cerebral venous thrombosis had more intracranial veins thrombosed than non-VITT patients; they also more frequently had extracranial thrombosis. Death or dependency occurred in 47% of patients with VITT-associated cerebral venous thrombosis. Non-heparin anticoagulants and immunoglobulin treatment might improve VITT outcome.

Cavanaugh AM, Spicer KB, Thoroughman D, Glick C, Winter K. Reduced Risk of Reinfection with SARS-CoV-2 After COVID-19 Vaccination — Kentucky, May–June 2021. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. ePub: 6 August 2021. DOI: http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm7032e1

La réponse immunologique provoquée par les vaccins pourrait être meilleure que la réponse provoquée par l'infection naturelle par le SRAS-CoV-2. Chez les résidents du Kentucky infectés par COVID en 2020, ceux qui n'étaient pas vaccinés avaient un risque de réinfection 2,34 fois plus élevé que ceux qui étaient complètement vaccinés.

The immunological response elicited by vaccines might be better than the response elicited by natural SARS-CoV-2 infection. In Kentucky residents infected by COVID in 2020, those who were not vaccinated had a 2.34 times higher risk of reinfection than those who were fully vaccinated.

 

Revue de bibliographie quotidienne Covid-19 (archives du 10 juillet 2021 au 26 août 2021)
Revue de bibliographie quotidienne Covid-19 (archives du 10 juillet 2021 au 26 août 2021)

Sansone A, Mollaioli D, Ciocca G, et al. “Mask up to keep it up”: Preliminary evidence of the association between erectile dysfunction and COVID-19. Andrology. 2021 Jul;9(4):1053-1059. PubMed: https://pubmed.gov/33742540. Full text: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/andr.13003 | See also the informal discussion at https://theconversation.com/covid-19-could-cause-male-infertility-and-sexual-dysfunction-but-vaccines-do-not-164139

La dysfonction érectile (DE) pourrait être une complication à court ou à long terme de la COVID-19. Dans cette analyse de 100 personnes (25 COVID‐positives et 75 COVID‐négatives), la prévalence de la dysfonction érectile était significativement plus élevée dans le groupe COVID+ (28 % contre 9,33 % ; p = 0,027).

De là à affirmer que les hommes qui défilent en ce moment seront impuissants, il y a un pas que la rigueur scientifique m'empêche de franchir. 😏

Erectile dysfunction (ED) could be a short‐ or long‐term complication of COVID‐19.  In this analysis of 100 people (25 COVID‐positive and 75 COVID‐negative), the prevalence of ED was significantly higher in the COVID+ group (28% vs. 9.33%; p = 0.027).

 

 

8 août 2021

Public Health England 202100806. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England | Technical briefing 20. UK Government 2021, 6 August. https://www.gov.uk/government/publications/investigation-of-novel-sars-cov-2-variant-variant-of-concern-20201201 | PDF: https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/1009243/Technical_Briefing_20.pdf

Pour les infections à variant Delta, le seuil du cycle de charge virale (Ct) est rapporté comme étant similaire pour les individus non vaccinés (17,8) et ceux avec un calendrier de vaccination complet (18,0). Les auteurs concluent que "des valeurs de Ct similaires (...) suggèrent une faible différence en matière d'infectiosité". Il existe toujours la possibilité que les personnes vaccinées excrètent le virus pendant une période plus courte. La vaccination peut également réduire le risque global d'infection d'un individu. En tout cas, il faut s'attendre à ce que la vaccination réduise la transmission du SRAS-CoV-2, même du variant Delta. Des discussions intéressantes à venir.

Again, for Delta variant infections, the viral load cycle threshold (Ct) is described as being similar for unvaccinated individuals (17.8) and those with a full vaccination schedule (18.0). The authors conclude that “similar Ct values (…) suggest limited difference in infectiousness.” Note that there is still the possibility that vaccinated people shed the virus for a shorter period of time. Vaccination may also reduce an individual’s overall risk of becoming infected. In any case, vaccination should be expected to reduce SARS-CoV-2 transmission, even of the Delta variant. Interesting discussions ahead.

Molteni E, Sudre CH, Canas LS, et al. Illness duration and symptom profile in symptomatic UK school-aged children tested for SARS-CoV-2. Lancet Child Adolesc Health 2021, published 3 August. https://doi.org/10.1016/S2352-4642(21)00198-X

Dans cette étude britannique concernant plus de 1700 enfants âgés de 5 à 17 ans qui a analysé les données rapportées par un proche adulte via une application mobile, 62% des enfants souffraient de céphalées et 55% d'épuisement. Chez les enfants plus jeunes (5 à 11 ans), la fièvre (44 %), les maux de gorge (36 %) et les gastralgies (28 %) étaient également courants. Parmi les enfants plus âgés, les symptômes comprenaient des maux de gorge (51 %), une anosmie (48 %), de la fièvre (35 %) et une toux persistante (26 %). Les enfants plus jeunes et plus âgés étaient malades pendant une médiane de cinq et sept jours, respectivement. 4,4 % des enfants présentaient des symptômes depuis au moins 28 jours ; ceci était plus fréquent chez les enfants plus âgés que chez les plus jeunes (5,1 % et 3,1 %, respectivement).

In this study of more than 1700 children age 5-17 that analyzed data reported by an adult proxy via a mobile application, 62% of children suffered from headaches and 55% from exhaustion. Among the younger children (5 to 11 years old), fever (44%), sore throat (36%) and stomach pain (28%) were also common. Among the older children, other symptoms included sore throat (51%), anosmia (48%), fever (35%) and persistent cough (26%). Younger and older children were sick for a median of five and seven days, respectively. 4.4% of the children had symptoms for at least 28 days; this was more commonly in older than younger children (5.1% and 3.1%, respectively).

7 août 2021

Israel A, Merzon E, Schäffer AA, et al. Elapsed time since BNT162b2 vaccine and risk of SARS-CoV-2 infection in a large cohort. medRxiv 2021, posted 5 August. Full text: https://doi.org/10.1101/2021.08.03.21261496

Une étude rétrospective d'Israël décrivant 33 993 adultes entièrement vaccinés a tenté de répondre à l'une des plus grandes questions de nos jours : le temps écoulé depuis la deuxième injection du vaccin BioNTech/Pfizer est-il significativement associé à un risque d'infection post-vaccinale à la COVID-19 ? Oui c'est le cas. Ceux qui ont reçu leur deuxième dose de vaccin au moins 146 jours avant un nouveau test RT-PCR (groupe 1) présentaient un risque d'infection plus élevé que ceux qui ont reçu leur vaccin moins de 146 jours avant (groupe 2). Les chiffres absolus sont un peu moins effrayants : parmi les personnes de plus de 60 ans, 182/7021 (2,6%) ont été testés positifs dans le groupe 1 et 19/2164 (0,9%) dans le groupe 2.

A retrospective study from Israel describing 33,993 fully vaccinated adults tried to answer one of the bigger questions these days: is the amount of time since the second injection of the BioNTech/Pfizer vaccine significantly associated with a risk of post-vaccination COVID-19 infection? Yes, it is. Those who received their second dose of vaccine at least 146 days before a new RT-PCR test (Group 1) had a higher risk of infection that those who received their vaccine less than 146 days before (Group 2). The absolute numbers are somewhat less scary: among people older than 60, 182/7021 (2.6%) tested positive in Group 1 and 19/2164 (0.9%) in Group 2.

Elliott P, Haw D, Wang H, et al. REACT-1 round 13 final report: exponential growth, high prevalence of SARS-CoV-2 and vaccine effectiveness associated with Delta variant in England during May to July 2021. Imperial College London 2021, published 4 August. https://spiral.imperial.ac.uk/handle/10044/1/90800

Angleterre. D'abord la bonne nouvelle : les personnes entièrement vaccinées ont une charge virale plus faible (Ct médiane : 27,6) que les personnes non vaccinées ou partiellement vaccinées (23,1), de sorte que les vaccins sont susceptibles de réduire le potentiel de transmission du variant Delta. Maintenant, la mauvaise nouvelle : entre le 24 juin et le 12 juillet 2021, avec le variant Delta déjà fermement installé au Royaume-Uni, 44% des infections se sont produites chez des individus entièrement vaccinés. Les auteurs estiment l'efficacité du vaccin contre l'infection à 49 %. Le sexe, l'origine ethnique, la taille du ménage et les niveaux économiques locaux ont également contribué conjointement au risque d'une prévalence plus élevée. Les auteurs prévoient qu'une mixité sociale accrue au cours de l'automne en présence du variant Delta pourrait entraîner une nouvelle vague de pandémie, même avec des niveaux élevés de vaccination.

First, the good news: fully vaccinated people have lower viral loads (median Ct: 27.6) than unvaccinated or partially vaccinated people (23.1), so vaccines are likely to decrease the potential for the transmission of the Delta variant. Now, the bad news: between 24 June and 12 July 2021, with the Delta variant already firmly established in the UK, 44% of infections occurred in fully vaccinated individuals. The authors estimate vaccine effectiveness against infection to be 49%. Sex, ethnicity, household size and local levels of economy also jointly contributed to the risk of higher prevalence. The authors anticipate that increased mixing during the autumn in the presence of the Delta variant may lead to a new wave of the pandemic, even at high levels of vaccination. [Note that men had higher odds of infection than women, a finding not seen in a previous analysis (20 May and 7 June). The reason? Increased social mixing during England’s progression in the Euro 2020 football competition during June and July 2021…]

 

Hakimian S, Raines D, Reed G, et al. Assessment of Video Capsule Endoscopy in the Management of Acute Gastrointestinal Bleeding During the COVID-19 Pandemic. JAMA Netw Open. 2021 Jul 1;4(7):e2118796. PubMed: https://pubmed.gov/34328500. Full text: https://doi.org/10.1001/jamanetworkopen.2021.18796

Les auteurs suggèrent que l'endoscopie par capsule vidéo peut constituer une alternative sûre à l'évaluation endoscopique standard des saignements gastro-intestinaux, car elle réduit le nombre de procédures invasives, le personnel impliqué et l'utilisation d'équipements de protection individuelle.

The authors suggest that “video capsule endoscopy can serve as a safe alternative to the standard endoscopic evaluation of gastrointestinal bleeding because it reduces the number of invasive procedures, personnel involved, and use of personal protective equipment.”

Corey L, Beyrer C, Cohen MS, Michael NL, Bedford T, Rolland M. SARS-CoV-2 Variants in Patients with Immunosuppression. N Engl J Med. 2021 Aug 5;385(6):562-566. PubMed: https://pubmed.gov/34347959. Full text: https://doi.org/10.1056/NEJMsb2104756

L'évolution du virus chez les patients immunodéprimés est-elle un facteur important dans l'émergence de variants préoccupants du SRAS-CoV-2 ? 

Is viral evolution in immunocompromised patients an important factor in the emergence of SARS-CoV-2 variants of concern? Read this nice summary of our current knowledge.

6 août 2021

Kimura I, Kosugi Y, Wu J, et al. SARS-CoV-2 Lambda variant exhibits higher infectivity and immune resistance. bioRxiv 2021, posted 28 July. Full-text: https://doi.org/10.1101/2021.07.28.454085

Après le Delta, le Lambda ? Déjà au Pérou, au Chili, en Argentine et en Equateur. Il possède des mutations qui confèrent une résistance à la vaccination.

More about the Lambda variant (also known as the C.37 lineage which is now spreading in South American countries such as Peru, Chile, Argentina, and Ecuador).
The authors describe three mutations or variants, the RSYLTPGD246-253N, L452Q and F490S mutations, which respectively confer resistance to vaccine-induced antiviral immunity. Additionally, the T76I and L452Q mutations contribute to enhanced viral infectivity.

Dermatoses dont zona après vaccination anti-covid-19 dont vaccins à ARNm :

REMAP-CAP, et al. Therapeutic Anticoagulation with Heparin in Critically Ill Patients with Covid-19. N Engl J Med 2021, published 4 July. Full text: https://doi.org/10.1056/NEJMoa2103417

Pas de bénéfice d'une HBPM ou de l'HNF en routine contre la covid en situation critique.

No benefit for critically ill patients with COVID-19 from routine therapeutic-dose anticoagulation with unfractionated or low-molecular-weight heparin. See also the comment by ten Cate H. Surviving Covid-19 with Heparin? N Engl J Med 2021, published 4 July. Full text: https://doi.org/10.1056/NEJMe2111151

5 août 2021

Hause AM, Gee J, Baggs J, et al. COVID-19 Vaccine Safety in Adolescents Aged 12–17 Years — United States, December 14, 2020–July 16, 2021. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. ePub: 30 July 2021. DOI: http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm7031e1

Au 16 juillet 2021, près de 9 millions d'adolescents américains âgés de 12 à 17 ans avaient reçu le vaccin BioNTech/Pfizer. La pharmacovigilance américaine a reçu 9 246 signalements, dont 90,7 % concernaient des événements indésirables non graves tandis que 9,3 % concernaient des événements indésirables graves, dont environ 400 cas de myocardite (4,3 % ; environ 1 pour 25 000 vaccinés ; voir également https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/70/wr/mm7027e2.htm). Les réactions systémiques étaient plus fréquentes après la deuxième dose.

As of July 16, 2021, almost 9 million US adolescents aged 12–17 years had received the BioNTech/Pfizer vaccine. The Vaccine Adverse Event Reporting System (VAERS) received 9246 reports, 90.7% of which were for non-serious adverse events while 9.3% were for serious adverse events, including around 400 cases of myocarditis (4.3%; about 1:25,000 vaccinees; see also https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/70/wr/mm7027e2.htm). Systemic reactions were more common after the second dose.

Xydakis MS, Albers MW, Holbrook EH, et al. Post-viral effects of COVID-19 in the olfactory system and their implications. Lancet Neurol. 2021 Jul 30:S1474-4422(21)00182-4. PubMed: https://pubmed.gov/34339626. Full text: https://doi.org/10.1016/S1474-4422(21)00182-4

Pourquoi perdons-nous notre odorat avec la COVID-19 ? Et quelles pourraient en être les conséquences ? Les auteurs proposent que, « chez les personnes qui se sont remises de la COVID-19, un déficit olfactif chronique, recrudescent ou permanent pourrait être l'indice d’une probabilité accrue de séquelles neurologiques ou de troubles neurodégénératifs à long terme ». Voir aussi le commentaire de Doty RL. Les mécanismes de perte d'odeur après infection par le SRAS-CoV-2. Lancet Neurol. 30 juillet 2021 : S1474-4422(21)00202-7. PubMed : https://pubmed.gov/34339627. Texte intégral : https://doi.org/10.1016/S1474-4422(21)00202-7

Why do we lose our smell with COVID-19? And what might be the consequences? The authors postulate that, “in people who have recovered from COVID-19, a chronic, recrudescent, or permanent olfactory deficit could be prognostic for an increased likelihood of neurological sequelae or neurodegenerative disorders in the long term.” See also the comment by Doty RL. The mechanisms of smell loss after SARS-CoV-2 infection. Lancet Neurol. 2021 Jul 30:S1474-4422(21)00202-7. PubMed: https://pubmed.gov/34339627. Full text: https://doi.org/10.1016/S1474-4422(21)00202-7

4 août 2021

Chia PY, Ong S, Chiew CJ, et al. Virological and serological kinetics of SARS-CoV-2 Delta variant vaccine-breakthrough infections: a multi-center cohort study. medRxiv 2021, posted 31 July. Full text: https://doi.org/10.1101/2021.07.28.21261295

A singapour, covid malgré Pfizer ou Moderna : déclin plus rapide de la charge virale, moindres besoins en oxygène.

Singapore, 218 patients admitted to hospital with Delta (B.1.617.2) SARS-CoV-2 infection. Vaccination (mostly with the BioNTech/Pfizer or Moderna vaccines) was associated with a faster decline in RNA viral load. The odds of severe COVID-19 requiring oxygen supplementation was significantly lower following vaccination (adjusted odds ratio 0.07, p = 0.001). PCR cycle threshold (Ct) values were similar between vaccinated and unvaccinated groups at diagnosis, but viral loads decreased faster in vaccinated individuals.

3 août 2021

DREES 20210729. Entrées hospitalières et décès de patients Covid-19 selon le statut vaccinal et la présence de la mutation L452R. DREES 2021 (Direction de la recherche, des études, de l’évaluation et des statistiques), published 29 July. Full text : https://solidarites-sante.gouv.fr/IMG/pdf/2021-07-23_-_sivic-sidep-vacsi_premiers_resultats_-_drees-2.pdf

En France, entre le 31 mai et le 11 juillet 2021, les personnes non vaccinées représentaient environ 85 % des patients COVID-19 hospitalisés, aussi bien en unité de soins intensifs que hors unité de soins intensifs. Les patients complètement vaccinés ne représentaient que 7 % des admissions.

In France, between 31 May and 11 July 2021, unvaccinated people represented around 85% of COVID-19 patients hospitalized, both in ICU units and non-ICU units. Fully vaccinated patients made up only 7% of admissions.

Texte complet :

Merrill ED, Kashem SW, Amerson EH, et al. Association of Facial Pustular Neutrophilic Eruption With Messenger RNA-1273 SARS-CoV-2 Vaccine. JAMA Dermatol. 2021 Jul 28. PubMed: https://pubmed.gov/34319363. Full text: https://doi.org/10.1001/jamadermatol.2021.2474

Les auteurs rapportent une éruption faciale qui s'est développée dans les 24 heures après avoir reçu le vaccin Moderna chez 2 patients sans antécédents d'allergies connues, de rosacée, d'application de substances faciales/dentaires ou d'infection antérieure par le SRAS-CoV-2.

The authors report a facial eruption that developed within 24 hours after receiving the Moderna vaccine in 2 patients without a history of known allergies, rosacea, facial/dental fillers, or prior SARS-CoV-2 infection.

Sikkens JJ, Buis DTP, Peters EJG, et al. Serologic Surveillance and Phylogenetic Analysis of SARS-CoV-2 Infection Among Hospital Health Care Workers. JAMA Netw Open. 2021 Jul 1;4(7):e2118554. PubMed: https://pubmed.gov/34319354. Full text: https://doi.org/10.1001/jamanetworkopen.2021.18554

Dans cette étude de cohorte portant sur 801 employés hospitaliers (HCW), le risque d'être infecté par le SRAS-CoV-2 était presque 4 fois plus élevé chez les HCW dans les services COVID-19 que chez les HCW ne prenant pas en charge des patients. Il n'y avait aucune preuve de transmission de patient à HCW, mais plusieurs occurrences de transmission d'HCW à HCW. 

In this cohort study of 801 hospital health care workers (HCWs), the risk of getting infected with SARS-CoV-2 was nearly 4-fold higher among HCWs on COVID-19 wards compared with HCWs not in patient care. There was no evidence for patient-to-HCW transmission but several occurrences of HCW-to-HCW transmission.

2 août 2021

Butler CC, Yu LM, Dorward J, et al. Doxycycline for community treatment of suspected COVID-19 in people at high risk of adverse outcomes in the UK (PRINCIPLE): a randomised, controlled, open-label, adaptive platform trial. Lancet Resp Med 2021, published 27 July. Full text: https://doi.org/10.1016/S2213-2600(21)00310-6

Doxycycline : éviter.

Don’t use doxycycline as a routine treatment for COVID-19! In patients with suspected COVID-19 who were at high risk of adverse outcomes, treatment with doxycycline was not associated with clinically meaningful reductions in time to recovery, hospital admissions or deaths related to COVID-19.

Araujo-Silva CA, Marcos AAA, Marinho PM, et al. Presumed SARS-CoV-2 Viral Particles in the Human Retina of Patients With COVID-19. JAMA Ophthalmol. 2021 Jul 29. PubMed: https://pubmed.gov/34323931. Full text: https://doi.org/10.1001/jamaophthalmol.2021.2795

Même la rétine peut être concernée.

Post-mortem analysis of enucleated eyes of three patients with confirmed COVID-19 infection revealed presumed S and N COVID-19 proteins within endothelial cells close to the capillary flame and cells of the inner and the outer nuclear layers. This finding may explain some of the infection’s ocular clinical manifestations.

Fallah M. Remember Ebola: stop mass death in Africa. Nature. 2021 Jul;595(7869):627. PubMed: https://pubmed.gov/34316054. Full text: https://doi.org/10.1038/d41586-021-01964-2

Le risque d'une nouvelle culpabilité collective devant l'Histoire. « Les pays riches accumulent des vaccins, laissant les doses expirer tandis que les personnes non vaccinées qui veulent se faire vacciner meurent. »

“Rich countries are hoarding vaccines, allowing doses to expire while unvaccinated people who want to be immunized die.”

1er août 2021

Schooley RT. Introduction to the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS CoV-2) Supplement, Clinical Infectious Diseases, Volume 73, Issue Supplement_2, 1 August 2021, Page S119, https://doi.org/10.1093/cid/ciab524

Huit manuscrits sur le fondement scientifique des interventions non biologiques. Entre autres sujets : 1) l'importance des aérosols et de l'excrétion virale pré-symptomatique ; 2) l'impact de la distanciation et du masque sur la prévention de la transmission virale ; 3) la surestimation initiale du rôle des vecteurs passifs (matériaux) et des gouttelettes dans la transmission virale.

Eight manuscripts about the scientific underpinning of non-biological interventions. Among other topics: 1) the importance of aerosols and pre-symptomatic shedding; 2) the impact of distancing and masking on preventing ongoing viral transmission; 3) initial overestimation of the role of fomites and of droplets in viral transmission.

Krantz MS, Kwah JH, Stone CA Jr, et al. Safety Evaluation of the Second Dose of Messenger RNA COVID-19 Vaccines in Patients With Immediate Reactions to the First Dose. JAMA Intern Med. 2021 Jul 26. PubMed: https://pubmed.gov/34309623. Full text: https://doi.org/10.1001/jamainternmed.2021.3779

Les 159 patients ayant eu une réaction allergique immédiate à la première dose du vaccin Pfizer/BioNTech ou Moderna, dont 19 personnes souffrant d'anaphylaxie à la première dose, ont toléré la deuxième dose. Une prémédication antihistaminique avait été administrée à 47 patients [30%] avant la deuxième dose. Trente-deux patients (20 %) ont signalé des symptômes immédiats et potentiellement allergiques associés à la deuxième dose qui étaient spontanément résolutifs, légers et/ou résolus avec les antihistaminiques seuls.

All 159 patients with an immediate allergic reaction to the first dose of the Pfizer/BioNTech or Moderna vaccine, including 19 individuals with first-dose anaphylaxis, tolerated the second dose. (Antihistamine pre-medication had been given to 47 patients [30%] before the second dose). Thirty-two patients (20%) reported immediate and potentially allergic symptoms that were associated with the second dose that were self-limiting, mild, and/or resolved with antihistamines alone.

Chowell G, Dahal S, Bono R, et al. Harnessing testing strategies and public health measures to avert COVID-19 outbreaks during ocean cruises. Sci Rep 11, 15482 (2021). Full text: https://doi.org/10.1038/s41598-021-95032-4

Vive les vacances en croisière ! Un bateau de croisière n'est pas un bon endroit où se trouver pendant une pandémie avec agent pathogène respiratoire telle que la covid-19. Cette étude révèle que les tests PCR à l'embarquement et les tests quotidiens de toutes les personnes à bord, ainsi qu'une distanciation sociale accrue, pourraient être en mesure de réduire la probabilité de propagation de la maladie.

Au niveau personnel, il pourrait y avoir une stratégie encore plus prometteuse : éviter les bateaux de croisière jusqu'à ce que la pandémie soit sous contrôle.

A cruise ship is not a good place to be during a pandemic of a respiratory pathogen. This study finds that PCR testing at embarkation and daily testing of all individuals aboard, together with increased social distancing, might be able to reduce the probability of onboard COVID-19 community spread. At the personal level, there might be an even more promising strategy: avoid cruise ships until the pandemic is under control.

31 juillet 2021

Brown CM, Vostok J, Johnson H, et al. Outbreak of SARS-CoV-2 Infections, Including COVID-19 Vaccine Breakthrough Infections, Associated with Large Public Gatherings — Barnstable County, Massachusetts, July 2021. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. ePub: 30 July 2021. DOI: http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm7031e2

Mauvaise nouvelle. Grand rassemblement dans le Massachusetts en juillet 2021 avec vaccinés et non-vaccinés : le Delta ne discrimine pas les deux populations.

Bad news from Barnstable County, Massachusetts. In July 2021, following multiple summer events and large public gatherings, 469 COVID-19 cases were identified among Massachusetts residents who had traveled to the town during July 3–17. Intriguingly, 346 (74%) occurred in fully vaccinated persons. Even more intriguingly: cycle threshold values were similar among specimens from patients who were fully vaccinated and those who were not. The driving force behind the outbreak: the Delta variant.

Wu S, Huang J, Zhang Z, et al. Safety, tolerability, and immunogenicity of an aerosolised adenovirus type-5 vector-based COVID-19 vaccine (Ad5-nCoV) in adults: preliminary report of an open-label and randomised phase 1 clinical trial. Lancet Resp Med 2021, published 26 July. Full text: https://doi.org/10.1016/S1473-3099(21)00396-0

En attente du vaccin intranasal : un vaccin aérosolisé à adénovirus produit une réponse  similaire à une injection de vaccin IM. La dose administrée est pourtant de 1/5ème à 2/5ème de celle de la voie IM.

Two doses of an aerosolized adenovirus type-5 vector-based COVID-19 vaccine – equivalent to a fifth or two-fifths of an intramuscular dose – were well-tolerated and did not produce serious side effects in healthy adults. They elicited strong IgG and neutralizing antibody responses similar to one dose of an intramuscular injection.

Katsoularis I, Fonseca-Rodríguez O, Farrington P. Risk of acute myocardial infarction and ischaemic stroke following COVID-19 in Sweden: a self-controlled case series and matched cohort study. Lancet 2021, published 29 July.

Risque accru d'infarctus de myocarde et d'AVC au décours de la covid-19. 

86,742 patients with COVID-19 and 348,481 matched controls. The authors find that COVID-19 is a risk factor for acute myocardial infarction and ischemic stroke and that both conditions are part of the clinical picture of COVID-19. See also a commentary by Mafham M, Baigent C. What is the association of COVID-19 with heart attacks and strokes? Lancet 2021, published 29 July. Full text: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)01071-0

Crook H, Raza S, Nowell J, Young M, Edison P. Long covid-mechanisms, risk factors, and management. BMJ. 2021 Jul 26;374:n1648. PubMed: https://pubmed.gov/34312178. Full-text: https://doi.org/10.1136/bmj.n1648

Covid long : le jour d'après. Fatigue, dyspnée, anomalies cardiaques, altération cognitive, troubles du sommeil. Une revue des facteurs de risque et des options thérapeutiques possibles.

The day after COVID-19: fatigue, dyspnea, cardiac abnormalities, cognitive impairment, sleep disturbances, etc. A state-of-the-art review of long COVID, discussing risk factors and possible therapeutic options.

30 juillet 2021

CDC 20210727. When You’ve Been Fully Vaccinated | How to Protect Yourself and Others. CDC 2021, published 27 July. Full text: https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/vaccines/fully-vaccinated.html

Le Delta change les règles du jeu. Les nouvelles directives de port de masque du CDC  : « Pour maximiser la protection contre le variant Delta et éviter éventuellement de le propager à d'autres, portez un masque à l'intérieur en public si vous vous trouvez dans une zone de transmission importante ou élevée. »

Delta is changing the rules of the game. The new CDC mask-wearing guidelines for the smarter part of the population: “To maximize protection from the Delta variant and prevent possibly spreading it to others, wear a mask indoors in public if you are in an area of substantial or high transmission.”

Bergwerk M, Gonen T, Lustig Y, et al. Covid-19 Breakthrough Infections in Vaccinated Health Care Workers. N Engl J Med. 2021 Jul 28. PubMed: https://pubmed.gov/34320281. Full-text: https://doi.org/10.1056/NEJMoa2109072

Long COVID malgré la vaccination chez des soignants vaccinés ? La plupart des infections à covid-19 au cours de la période de quatre mois suivant la deuxième dose de vaccin (39/1497, 0,4 %) étaient légères ou asymptomatiques ; cependant, 7 patients (19%) ont présenté des symptômes persistants (> 6 semaines), notamment des céphalées, des myalgies, une agueusie, une anosmie ainsi que de la fatigue, ce qui indique qu'un long COVID peut survenir chez les personnes ayant souffert d'infection aiguë après vaccination. A noter que l'étude a été effectuée dans la période pré-Delta (du 20 janvier au 28 avril 2021; 85 % des échantillons ont objectivé la souche Alpha [B.1.1.7]). Attendons-nous à ce que les données soient moins favorables dans le contexte où le Delta (B.1.617.2) devient la souche dominante. Il peut être judicieux de suivre les nouvelles directives du CDC et de porter des masques à l'intérieur dans les situations à risque.

Long COVID after breakthrough infections? Most breakthrough infections during the 4-month period after the second vaccine dose (39/1497, 0.4%) were mild or asymptomatic; however, 7 patients (19%) had persistent symptoms (> 6 weeks), including headaches, muscle pain, loss of taste and smell and fatigue), indicating that Long COVID may occur among people who experience breakthrough infections. Note that the study is from the pre-Delta world (20 January through 28 April; 85% of the samples yielded the Alpha strain [B.1.1.7]). Expect the data to be less favorable in settings where Delta (B.1.617.2) is the dominant strain. It may be wise to follow the new CDC guidelines and wear masks indoors in risky situations (see the next paragraph, “Prevention”).

Scudellari M. How the coronavirus infects cells — and why Delta is so dangerous. Nature 2021, published 28 July. Full text: https://www.nature.com/articles/d41586-021-02039-y

Comment le virus infecte les cellules et pourquoi le Delta est si dangereux. Wendy Barclay, Imperial College de Londres : « Deux variants de coronavirus, l'Alpha et le Delta, ont altéré les sites de clivage de la furine. Dans la variante Alpha, l'acide aminé proline initial est changé en histidine (P681H); dans la variante Delta, il est remplacé par une arginine (P681R). Les deux changements rendent la séquence moins acide, et plus la chaîne d'acides aminés est alcaline, plus la furine la reconnaît et la coupe efficacement.

Wendy Barclay, Imperial College London: “Two coronavirus variants, Alpha and Delta, have altered furin cleavage sites. In the Alpha variant, the initial proline amino acid is changed to a histidine (P681H); in the Delta variant, it is changed to an arginine (P681R). Both changes make the sequence less acidic, and the more basic the string of amino acids, the more effectively furin recognizes and cuts it.”

Thomas SJ, Moreira ED, Kitchin N, et al. Six Month Safety and Efficacy of the BNT162b2 mRNA COVID-19 Vaccine. medRxiv 2021, posted 28 July. Full text: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.07.28.21261159v1

Protection pas le Pfizer : au moins six mois.

Six-month efficacy data from the Pfizer/BioNTech vaccine trial: 1) Efficacy declining from 96% at 2 months to 85% at 4-6 months for infection, for an average decline of ~6% every two months; 2) Protection against severe illness was 97% through at least 6 months.

Guimarães PO, Quirk D, Furtado RH, et al. Tofacitinib in Patients Hospitalized with Covid-19 Pneumonia. N Engl J Med. 2021 Jul 29;385(5):406-415. PubMed: https://pubmed.gov/34133856. Full-text: https://doi.org/10.1056/NEJMoa2101643

 Le tofacitinib est un inhibiteur sélectif de la Janus kinase (Jak) ; administré par voie orale, qui bloque les voies de transduction intracellulaire après qu'une cytokine s'est liée à son récepteur (en conséquence, aucune réponse cellulaire n'est déclenchée et la production de cytokines est indirectement supprimée). Parmi les patients hospitalisés pour une pneumonie au COVID-19, le tofacitinib a entraîné un risque plus faible de décès ou d'insuffisance respiratoire jusqu'au jour 28 que le placebo. L'incidence cumulée de décès ou d'insuffisance respiratoire était de 18,1 % versus 29,0 % dans le groupe placebo (risque relatif 0,63 ; IC à 95 % : 0,41 à 0,97 ; p = 0,04).

Now in NEJM’s print edition. Our previous comment on the online publication (16 June): tofacitinib (Wikipedia) is an orally administered selective inhibitor of Janus kinase (Jak), that blocks intracellular transduction pathways after a cytokine is bound to its receptor (as a consequence, no cellular response is triggered, and cytokine production is indirectly suppressed). Among patients hospitalized with COVID-19 pneumonia, tofacitinib led to a lower risk of death or respiratory failure through day 28 than did placebo. The cumulative incidence of death or respiratory failure was 18.1% versus 29.0% in the placebo group (risk ratio, 0.63; 95% CI: 0.41 to 0.97; p = 0.04).

29 juillet 2021

Schrock JM, Ryan DT, Saber R, et al. Cohabitation With a Known Coronavirus Disease 2019 Case Is Associated With Greater Antibody Concentration and Symptom Severity in a Community-Based Sample of Seropositive Adults. Open Forum Infectious Diseases, Volume 8, Issue 7, 24 July 2021. Full text: https://doi.org/10.1093/ofid/ofab244

Les personnes  séropositives au SARS-CoV-2 qui vivaient avec un cas connu de COVID-19 présentaient une plus grande sévérité des symptômes et des niveaux d'IgG anti-SRAS-CoV-2 RBD plus élevés que les personnes séropositives qui ne vivaient pas avec un cas connu de COVID-19. Ces résultats appellent à des recherches supplémentaires pour savoir si l'intensité ou la durée de l'exposition virale explique la relation entre l'exposition à domicile, la gravité des symptômes et les concentrations d'anticorps.

The authors find that those who lived with a known COVID-19 case exhibited greater symptom severity compared to those who did not live with a known COVID-19 case. Does the duration of viral exposure explain this relation between household exposure and symptom severity?

28 juillet 2021

Paetzold J, Krammer F, van Laer D, et al. The effects of rapid mass vaccination against SARS-CoV-2 and its Variants-of-Concern: Evidence from an early VoCs hotspot. Research Square 2021, posted 24 July. Full text: https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-741944/v1

Suite à une importante épidémie des variants Beta (B.1.351, « Afrique du Sud » et Alpha (B.1.1.7/E484K, « Angleterre ») dans le district de Schwaz, en Autriche, plus de 70 % de la population adulte du district a reçu sa première dose de vaccin Pfizer/BioNTech dans les 6 jours (11 et 16 mars). Résultat : une réduction de 60 % des nouvelles infections au SRAS-CoV-2 par rapport aux personnes résidant juste à proximité du district vacciné.

Following a large outbreak of the Beta (B.1.351, “South Africa”) and Alpha variants (B.1.1.7/E484K, “England”) in the district of Schwaz, Austria, more than 70% of the adult population of the district received their first Pfizer/BioNTech vaccine dose within 6 days (11 and 16 March). Result: a 60% reduction in new SARS-CoV-2 infections relative to people residing just outside of the vaccinated district.

27 juillet 2021

Public Health England 20210723. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England | Technical briefing 19. Public Health England 2021, published 23 July. Full text: https://www.gov.uk/government/publications/investigation-of-novel-sars-cov-2-variant-variant-of-concern-20201201

Le risque de réinfection avec le variant Delta peut être 1,46 fois plus élevé qu'avec le variante Alpha. Fait intéressant, le risque de réinfection n'était pas élevé si la primo-infection était < 180 jours, mais était plus élevé pour ceux qui avaient une infection antérieure ≥ 180 jours plus tôt (risque relatif = 2,37).

The risk of reinfection with the Delta variant may be 1.46 times higher than with the Alpha variant. Interestingly, the risk of reinfection was not elevated if the primary infection was < 180 days, but was higher for those with a prior infection ≥ 180 days earlier (adjusted odds ratio = 2.37).

 

Recalde M, Pistillo A, Fernandez-Bertolin S, et al. Body mass index and risk of COVID-19 diagnosis, hospitalisation, and death: a cohort study of 2 524 926 Catalans. J Clin Endocrinol Metab. 2021 Jul 23:dgab546. PubMed: https://pubmed.gov/34297116. Full-text: https://doi.org/10.1210/clinem/dgab546

Dans cette étude réalisée en Espagne dans une cohorte de 2 524 926 catalans, un indice de masse corporelle (IMC) de 31 kg/m2 était associé à un risque plus élevé de diagnostic (risque relatif 1,22) et d'hospitalisation (1,88) par rapport aux personnes ayant un IMC de 22 kg/m2. Il y avait un risque accru de décès plus prononcé pour les IMC 40 kg/m2. L'augmentation du risque de survenue de COVID-19 a été particulièrement prononcée chez les patients les plus jeunes.

In this study from Spain, a body mass index (BMI) of 31kg/m2 was associated with a higher risk for diagnosis (hazard ratio, 1.22) and hospitalization (1.88) compared to people with a BMI of 22kg/m2. There was also a more pronounced increasing risk of death for BMIs ≥ 40kg/m2. The increase in risk for COVID-19 outcomes was particularly pronounced among younger patients.

 

26 juillet 2021

Robinson KA, Maimone S, Gococo-Benore DA, Li Z, Advani PP, Chumsri S. Incidence of Axillary Adenopathy in Breast Imaging After COVID-19 Vaccination. JAMA Oncol. 2021 Jul 22. PubMed: https://pubmed.gov/34292295. Full-text: https://doi.org/10.1001/jamaoncol.2021.3127

Adénopathie axillaire après vaccination contre le SARS-CoV-2 : plus fréquente. Donc imagerie mammaire à repousser 4 à 6 semaines après cette deuxième injection.

In this retrospective analysis (n = 750), 23 (3%) patients had axillary adenopathy on mammography. This incidence is higher than axillary adenopathy in otherwise normal mammography (0.02% – 0.04%). The incidence of adenopathy decreased over time with no adenopathy seen in patients who received the vaccine more than 28 days previously. When possible, consider scheduling screening breast imaging 4 to 6 weeks after the second COVID-19 vaccination dose (National Comprehensive Cancer Network, 15 June 2021, Recommendations of the NCCN COVID-19 Vaccination Advisory: https://www.nccn.org/docs/default-source/covid-19/2021_covid-19_vaccination_guidance_v3-0.pdf

25 juillet 2021

Else H. COVID and mass sport events: early studies yield limited insights. Nature 2021, published 22 July. Full text: https://www.nature.com/articles/d41586-021-02016-5

Grands rassemblements : éviter.

Is it safe to attend large gatherings? Maybe not yet.

Mazagatos C, Monge S, Olmedo C, et al. Effectiveness of mRNA COVID-19 vaccines in preventing SARS-CoV-2 infections and COVID-19 hospitalisations and deaths in elderly long-term care facility residents, Spain, weeks 53 2020 to 13 2021. Euro Surveill. 2021 Jun;26(24):2100452. PubMed: https://pubmed.gov/34142647. Full-text: https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100452

Un groupe de résidents âgés (65 ans et plus) en établissement de soins de longue durée en Espagne : efficacité vaccinale partielle (EV) de 50 % avec la première dose du vaccin BioNTech/Pfizer et du vaccin Moderna. Après la deuxième dose, l'EV était de 71% contre l'infection par le SRAS-CoV-2, 88% et 97% contre les hospitalisations et les décès COVID-19, respectivement.

The same message from a group of elderly residents (aged 65 years and older) in long-term care facilities: partial vaccine effectiveness (VE) of 50% with the first dose of the BioNTech/Pfizer and the Moderna vaccine. After the second dose, VE was 71% against SARS-CoV-2 infection, 88% and 97% against COVID-19 hospitalizations and deaths, respectively.

Mateo-Urdiales A, Spila Alegiani S, Fabiani M, et al. Risk of SARS-CoV-2 infection and subsequent hospital admission and death at different time intervals since first dose of COVID-19 vaccine administration, Italy, 27 December 2020 to mid-April 2021. Euro Surveill. 2021 Jun;26(25):2100507. PubMed: https://pubmed.gov/34169819. Full-text: https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2021.26.25.2100507

Italie comme Israël : protection partielle dès la deuxième semaine après la première injection.

A report on 7,370,008 persons who had received their first dose of vaccine by 4 April 2021 in Italy. As in earlier studies from Israel, a partial protection can be seen as early as two weeks after the first dose.

Pas de modification du sperme retrouvée après deux injections de vaccins à ARNm.

Source :

24 juillet 2021

Wei J, Stoesser N, Matthews PC, et al. Antibody responses to SARS-CoV-2 vaccines in 45,965 adults from the general population of the United Kingdom. Nat Microbiol. 2021 Jul 21. PubMed: https://pubmed.gov/34290390. Full-text: https://doi.org/10.1038/s41564-021-00947-3

Dans cette cohorte britannique de 45 965 adultes, les taux de séroconversion et les taux d'anticorps après une seule dose de vaccin étaient plus faibles chez les personnes âgées, en particulier chez celles âgées de > 60 ans. Les faibles répondeurs étaient plus fréquents chez les personnes prenant des immunosuppresseurs ou des corticostéroïdes, ainsi que chez les patients atteints de polyarthrite rhumatoïde, de pathologie hépatique chronique, de cancer, de diabète de type 2, d'obésité et d'asthme.

In this UK cohort of 45,965 adults, seroconversion rates and antibody levels after a single vaccine dose were lower in older individuals, especially in those aged > 60 years. Low responders were more common among people taking immunosuppressants or corticosteroids, as well as in patients with rheumatoid arthritis, chronic liver disease, cancer, type 2 diabetes, obesity, and asthma.

Ito K, Piantham C, Nishiura H. Predicted dominance of variant Delta of SARS-CoV-2 before Tokyo Olympic Games, Japan, July 2021. Euro Surveill. 2021 Jul;26(27):2100570. PubMed: https://pubmed.gov/34240695. Full-text: https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2021.26.27.2100570

Les participants aux JO vont-ils ramener le Delta ?

In many countries, the Delta variant (B.1.671.2) has already replaced other variants. The authors show that in Japan, the replacement is likely to happen mostly before the start of the Tokyo Olympic Games on 23 July 2021. A substantial number of international visitors might be exposed and help spread the Delta variant around the world.

23 juillet 2021

Lopez Bernal J, Andrews N, Gower C, et al. Effectiveness of Covid-19 Vaccines against the B.1.617.2 (Delta) Variant. N Engl J Med. 2021 Jul 21. PubMed: https://pubmed.gov/34289274. Full-text: https://doi.org/10.1056/NEJMoa2108891

L'efficacité après une dose de BioNTech/Pfizer ou d'AstraZeneca était plus faible chez les individus infectés par le variant Delta (B.1.671.2, « indien ») qu'avec le variant Alpha (B.1.1.7, « anglais»): Delta, 30,7% – Alpha, 48,7% (il n'y avait pas de différence entre les deux vaccins). Après deux doses, les différences d'efficacité du vaccin entre les deux variants étaient modestes, mais le vaccin BioNTech/Pfizer était supérieur au vaccin AstraZeneca (BioNTech/Pfizer : Delta, 88,0 % – Alpha, 93,7 % ; AstraZeneca : Delta, 67,0 % ; Alpha , 74,5%.

Effectiveness after one dose of the BioNTech/Pfizer or AstraZeneca was lower among individuals infected with the Delta variant (B.1.671.2, “India”) than with the Alpha variant (B.1.1.7, “England”): Delta, 30.7% – Alpha, 48.7% (there was no difference between the two vaccines). After two doses, differences in vaccine effectiveness with the two variants were modest, but the BioNTech/Pfizer vaccine was superior to the AstraZeneca vaccine (BioNTech/Pfizer: Delta, 88.0% – Alpha, 93.7%; AstraZeneca: Delta, 67.0%; Alpha, 74.5%).

García-Azorín D, Sierra Á, Trigo J, et al. Frequency and phenotype of headache in covid-19: a study of 2194 patients. Sci Rep. 2021 Jul 19;11(1):14674. PubMed: https://pubmed.gov/34282206. Full-text: https://doi.org/10.1038/s41598-021-94220-6

Les céphalées peuvent être le symptôme révélateur de la COVID-19. Dans cette étude, le délai médian d'apparition des céphalées était dans les 24 h, avec une durée médiane de 7 jours. Chez 13 % des patients, la céphalée persistait après 1 mois. La plupart des patients ont décrit une céphalée bilatérale à prédominance frontale, de qualité oppressante et d'intensité sévère.

Headache may be the presenting symptom of COVID-19. In this study, median headache onset was within 24 h, with a median duration of 7 days. In 13% of patients, the headache persisted after 1 month. Most patients described a bilateral headache with frontal predominance, an oppressive quality, and severe intensity.

Hillis SD, Unwin HJT, Chen Y, et al. Global minimum estimates of children affected by COVID-19-associated orphanhood and deaths of caregivers: a modelling study. Lancet 2021, published 20 July. Full text: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)01253-8

Autre conséquence de la covid-19 : plus d'un million de nouveaux orphelins.

From March 1, 2020, to April 30, 2021, more than one million children lost at least one parent or custodial grandparent.

See also the comment by Kentor RA, Thompson AL. Answering the call to support youth orphaned by COVID-19. Lancet 2021, published 20 July. Full text: Lancet 2021, published 20 July. Full text: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(21)01253-8

22 juillet 2021

Ledford H. Should children get COVID vaccines? What the science says. Nature 2021, published 20 July. Full text: https://www.nature.com/articles/d41586-021-01898-9

Pendant que l'on débat et se débat en France avec l'obligation vaccinale, d'autres pays se confrontent à la pénurie de vaccins. Se posent alors des questions dans une autre dimension : qui vacciner en premier ? Par exemple des personnes vulnérables ou des adolescents; les rares complications du vaccin Pfizer à type de myocardite et de péricardite chez les adolescents masculins de 12 à 17 ans (67 cas par million de secondes doses) et féminins (9 cas par million de secondes doses) vont elles être dissuasives alors que la covid, bien que peu fréquente, peut entrainer des complications graves chez les sujets de cette tranche d'âge ?

Vaccinating children. Is it necessary? Is it safe? And how will it affect the pandemic?

Mateus J, Dan JM, Zhang Z, et al. Low dose mRNA-1273 COVID-19 vaccine generates durable T cell memory and antibodies enhanced by pre-existing crossreactive T cell memory. medRxiv 2021, posted 5 July. Full text: https://doi.org/10.1101/2021.06.30.21259787

Moderna protecteur au quart de dose ? Et sans effet secondaire ?

At 25 µg (instead of the four-fold higher 100 µg standard dose), the Moderna vaccine mRNA-1273 vaccine induced a durable and functional T cell and antibody response comparable to natural infection. If these preliminary findings are confirmed, the lower dose could accelerate the global immunization campaign (and perhaps help with side effects?).

21 juillet 2021

Brosh-Nissimov T, Orenbuch-Harroch E, Chowers M, et al. BNT162b2 vaccine breakthrough: clinical characteristics of 152 fully-vaccinated hospitalized COVID-19 patients in Israel. Clin Microbiol Infect. 2021 Jul 7:S1198-743X(21)00367-0. PubMed: https://pubmed.gov/34245907. Full-text: https://doi.org/10.1016/j.cmi.2021.06.036

Après Pfizer chez 152 patients israéliens qui ont développé une covid au moins une semaine après la deuxième injection et qui ont été hospitalisés. Parmi eux, leurs comorbidités : HTA pour 71%, diabète pour 48%, insuffisance cardiaque congestive pour 27%, pathologies pulmonaires pour 24%, insuffisance rénale pour 24%, démence chez 19% et cancer pour 24%. 40% étaient immunodéprimés et 22% sont morts (soit 34 patients). 

Retrospective study of 152 individuals who developed COVID-19 more than 7 days after the second BioNTech/Pfizer vaccine dose and required hospitalization. High rate of existing co-morbidities: hypertension (71%), diabetes (48%), congestive heart failure (27%), lung diseases (24%), chronic kidney (24%), dementia (19%) and cancer (24%). Importantly, 60 (40%) patients were immunocompromised. Thirty-four (22%) patients died.

Lucas C, Vogels CBF, Yildirim I, et al. Impact of circulating SARS-CoV-2 variants on mRNA vaccine-induced immunity in uninfected and previously infected individuals. medRxiv 2021, posted 18 July. Full text: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.07.14.21260307v1

Meilleure immunité si infection préalable que si vaccination et réduction de la neutralisation pour le Béta, le Gamma suivis par le Delta et l'Alpha.

Analysis of plasma neutralization using 16 SARS-CoV-2 variants. The Beta (B.1.351, ‘South Africa’) and Gamma (P.1, ‘Brazil’) strains, showed the greatest reduction, followed by the Delta (B.1.617.2, ‘India’) and Alfa (B.1.1.7, ‘England’) strains. Plasma from previously infected vaccinated individuals had a better neutralization than plasma from uninfected vaccinated individuals.

Coleman KK, Tay DJW, Tan KS, et al. Viral Load of SARS-CoV-2 in Respiratory Aerosols Emitted by COVID-19 Patients while Breathing, Talking, and Singing. medRxiv 2021, posted 19 July. Full text: https://doi.org/10.1101/2021.07.15.21260561

Bon, on peut s'arrêter de chanter et de parler mais il est encore permis de respirer.

In this study, fine aerosols (≤ 5μm) produced by talking and singing contained more SARS-CoV-2 copies than coarse aerosols. “The largest proportion of SARS-CoV-2 RNA copies was emitted by singing (53%), followed by talking (41%) and breathing (6%).”

20 juillet 2021

Li B, Deng A, Li K, et al. Viral infection and transmission in a large well-traced outbreak caused by the Delta SARS-CoV-2 variant. medRxiv 2021, posted 12 July. Full-text: https://doi.org/10.1101/2021.07.07.21260122

Delta : charge virale 1000 fois plus élevée et réduction de 6 à 4 jours entre le premier cas et le second quand ils présentenet des symptômes.

Explaining the forces behind the Delta wave: 1) 1000 times higher viral load and 2) a reduced serial interval, 4 days instead of 6 (the serial interval is defined as the duration of time between a primary case patient having symptom onset and a secondary case patient having symptom onset).

Dougherty K, Mannell M, Naqvi O, Matson D, Stone J. SARS-CoV-2 B.1.617.2 (Delta) Variant COVID-19 Outbreak Associated with a Gymnastics Facility – Oklahoma, April-May 2021. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2021 Jul 16;70(28):1004-1007. PubMed: https://pubmed.gov/34264910. Full-text: https://doi.org/10.15585/mmwr.mm7028e2

Delta : évitez la gymnastique encore davantage que... la maison.

In the coming months, avoid gyms. The Delta variant (B.1.617.2, first identified in India) is frighteningly transmissible (see article above) and will lead to increased attack rates, especially in households and in indoor sports settings. In this report, the attack rates at the gymnastics facility and in households were 20% and 53%, respectively.

Guimarães RM, Portela MC, Villela DAM, Matta GC, de Freitas CM. Younger Brazilians hit by COVID-19 – What are the implications? Lancet Regional Health 2021, published 14 July. Full text: https://doi.org/10.1016/j.lana.2021.100014

Chute de 13 ans de l'âge médian des décédés au Brésil depuis le début de 2021.

New variants and incomplete vaccination will lead to increasing numbers of young and middle-aged adults in intensive care units. In the months ahead, how far will the “youthening of the pandemic” go? In Brazil, among patients who died from COVID-19, the median age has dropped 13 years since the beginning of 2021.

19 juillet 2021

Said M, Davis P, Davis P, et al. A Rapid Olfactory Test as a Potential Screening Tool for COVID-19. JAMA Otolaryngol Head Neck Surg July 15, 2021. https://jamanetwork.com/journals/jamaotolaryngology/fullarticle/2782044?resultClick=1

Un test olfactif pour dépistage : sensibilité de 75% and spécificité de 95.2% en utilisant un test PCR comme référence.

In this pilot study, a novel olfactory test alone had a sensitivity of 75% and specificity of 95.2% in detecting COVID-19 using PCR testing as the gold standard.

Drake TM, Riad AM, Fairfield CJ, et al. Characterisation of in-hospital complications associated with COVID-19 using the ISARIC WHO Clinical Characterisation Protocol UK: a prospective, multicentre cohort study. Lancet July 17, 2021. Volume 398, ISSUE 10296, P223-237, July 17, 2021. https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(21)00799-6/fulltext

Des conséquences sévères esn sortie d'hospitalisation, y compris chez des jeunes en bonne santé, les complications neurologiques possédant le pronostic le plus défavorable.

Hospitalization with COVID-19 is associated with high rates of morbidity in adults. In this large prospective cohort study, almost half of the survivors had one or more complications. Rates were high even in young, previously healthy individuals. Acute complications were associated with reduced ability to self-care at discharge, with neurological complications being associated with the worst functional outcomes.

Yoshikawa Y, Kawachi I. Association of Socioeconomic Characteristics With Disparities in COVID-19 Outcomes in Japan. JAMA Netw Open July 14. 2021;4(7):e2117060. https://jamanetwork.com/journals/jamanetworkopen/fullarticle/2781935?resultClick=1

Inégalités face à la Covid-19 : au Japon aussi. Pas surprenant : revenus faibles, population recevant une assistance publique, un taux de chômage plus élevé, un nombre plus grand de travailleurs de la distribution, des transports et des postes ainsi que de la restauration. Davvantage si nombreux à la maison, tabagisme et obésité.

Disparities in COVID-19 outcomes are not unique to the US and Europe: in this cross-sectional study of the 47 prefectures in Japan, a higher burden of COVID-19 cases and deaths was observed in prefectures with lower household incomes; a higher proportion of the population receiving public assistance; a higher unemployment rate; higher numbers of retail, transportation and postal, and restaurant industry workers; more household crowding; and higher smoking and obesity rates.

Oldenburg CE, Pinsky BA, Brogdon J, et al. Effect of Oral Azithromycin vs Placebo on COVID-19 Symptoms in Outpatients With SARS-CoV-2 Infection – A Randomized Clinical Trial. JAMA July 16, 2021. doi:10.1001/jama.2021.11517

Encore un essai clinique défavorable à l'utilisation d'azithromycine.

In this randomized trial that included 263 outpatients with SARS-CoV-2 infection, treatment with a single oral dose of azithromycin, 1.2 g, vs placebo resulted in self-reported absence of COVID-19 symptoms at day 14 in 50% vs 50%.

18 juillet 2021

Barouch DH, Stephenson KE, Sadoff J, et al. Durable Humoral and Cellular Immune Responses 8 Months after Ad26.COV2.S Vaccination. NEJM July 14, 2021. https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2108829?query=featured_home

Après Janssen, immunités cellulaire et humorale maintenues avec une décroissance minimale au bout de 8 mois. Développement des anticorps neutralisants y compris contre le Delta.

This small study indicates that the Ad26.COV2.S vaccine (J&J) elicited durable humoral and cellular immune responses with minimal decreases for at least 8 months. Moreover, there was an expansion of neutralizing antibody breadth associated with improved coverage of SARS-CoV-2 variants over time, including increased neutralizing antibody titers against Delta.

Ferreira I, Kemp S, Datir R, et al. SARS-CoV-2 B.1.617 mutations L452 and E484Q are not synergistic for antibody evasion. J Infect Dis July 14, 2021, jiab368. https://academic.oup.com/jid/advance-article/doi/10.1093/infdis/jiab368/6321359

Des modifications de la protéine Spike telles que vues sur le Delta ne diminuent que faiblement l'efficacité du Pfizer.

Spike bearing L452R and E484Q (as seen in Delta) confers modestly reduced sensitivity to BNT162b2 mRNA vaccine-elicited antibodies. The effect is similar in magnitude to the loss of sensitivity conferred by L452R or E484Q alone.

Bennett TD, Moffitt RA, Hajagos JG, et al. Clinical Characterization and Prediction of Clinical Severity of SARS-CoV-2 Infection Among US Adults Using Data From the US National COVID Cohort Collaborative. JAMA Netw Open Jul 13, 2021;4(7):e2116901. https://jamanetwork.com/journals/jamanetworkopen/fullarticle/2781923?resultClick=1

USA : facteurs indépendants de sévérité. L'âge, le sexe masculin, une affection hépatique, une démence, le fait d'être une personne de peau noire ou d'origine asiatique, l'obésité.

In this cohort study of 174,568 adults with SARS-CoV-2, 32,472 (18.6%) were hospitalized and 6565 (20.2%) got severely ill, and first-day machine learning models accurately predicted clinical severity. Mortality decreased from 16.4% in March to April 2020 to 8.6% in September to October 2020. In a separate multivariate logistic regression model built for inference, age (odds ratio, 1.03 per year), male sex (OR, 1.60), liver disease (OR, 1.20), dementia (OR, 1.26), African-American (OR, 1.12) and Asian (OR, 1.33) race, and obesity (OR, 1.36) were independently associated with higher clinical severity.

17 juillet 2021

Williamson EJ, McDonald HI, Bhaskaran K, et al. Risks of covid-19 hospital admission and death for people with learning disability: population based cohort study using the OpenSAFELY platform. BMJ July 14, 2021; 374. https://www.bmj.com/content/374/bmj.n1592

Trisomie 21 : davantage de Covid-19.

This large population-based cohort study from England indicates that people with learning disability have markedly increased risks of hospital admission and death from covid-19, over and above the risks observed for non-covid causes of death. Down’s syndrome and cerebral palsy were associated with increased hazards for both events; Down’s syndrome to a greater extent.

Williams SV, Vusirikala A, Ladhani SN, et al. An outbreak caused by the SARS-CoV-2 Delta (B.1.617.2) variant in a care home after partial vaccination with a single dose of the COVID-19 vaccine Vaxzevria, London, England, April 2021. Euro Surveill. 2021;26(27):pii=2100626. https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2021.26.27.2100626

Soignants et patients mal protégés contre le Delta par une seule dose d'AstraZeneca mais hospitalisation peu fréquente et pas de décès.

The Delta attack rate after the first dose of Astra Zeneca’s vaccine was 35.7% (5/14) for staff and 81.3% (13/16) for residents, indicating lower protection in people who had received only one dose of the Vaxzevria vaccine within 3 months. Reassuringly, though, hospitalisation was uncommon and there were no deaths, providing some evidence that a single dose of vaccine may be protective against severe disease following infection with the Delta variant.

Normark J, Vikström L, Gwon YD, et al. Heterologous ChAdOx1 nCoV-19 and mRNA-1273 Vaccination. NEJM July 14, 2021. https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2110716?query=featured_home

Meilleure efficacité du MODERNA mais davantage d'effets secondaires que l'AstraZeneca : fièvre, céphalée, frissons, myalgies.

This relatively small cohort suggests that the mRNA-1273 vaccine (MODERNA) boost may provide better protection against the B.1.351 variant than a ChAdOx1 nCoV-19 boost. However, the mRNA-1273 boost led to more frequent reports of fever, headache, chills, and muscle aches than the ChAdOx1 nCoV-19 boost.

Kimihito I, Chayada P, NHiroshi N. Predicted dominance of variant Delta of SARS-CoV-2 before Tokyo Olympic Games, Japan, July 2021. Euro Surveill. 2021;26(27):pii=2100570. https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2021.26.27.2100570

Moins d'une semaine avant que le Delta ne remplace les autres variants au Japon.

It is just a matter of time for the Delta variant to replace other variants in Japan. This study shows that the replacement is likely to happen mostly before the start of the Tokyo Olympic Games on 23 July 2021.

16 juillet 2021

Rossi AH, Ojeda DS, Varese A, et al. Sputnik V Vaccine Elicits Seroconversion and Neutralizing Capacity to SARS CoV-2 after a Single Dose. Cell Rep Med July 13, 2021. https://www.cell.com/cell-reports-medicine/fulltext/S2666-3791(21)00208-1

Sputnik V plus efficace dès la première dose chez des soignants argentins déjà infectés.

Of 227 seronegative healthcare workers in Argentina, 94% developed spike-specific IgG antibodies at day 21 after the first dose. A single Sputnik V dose elicited higher antibody levels and virus neutralizing capacity in 67 previously infected individuals than in naïve ones receiving the full two-dose schedule.

Bui LT, Winters NI, Chung MIm et al. Chronic lung diseases are associated with gene expression programs favoring SARS-CoV-2 entry and severity. Nat Commun Jul 14, 2021, 12, 4314. https://www.nature.com/articles/s41467-021-24467-0

Pathologies respiratoires chroniques : un mécanisme génétique favorisant la sévérité de la covid.

Chronic lung disease AT2 cells express higher levels of genes linked directly to the efficiency of viral replication and the innate immune response.

Mura C, Preissner S, Nahles S, et al. Real-world evidence for improved outcomes with histamine antagonists and aspirin in 22,560 COVID-19 patients. Sig Transduct Target Ther July 14, 2021, 6, 267. https://www.nature.com/articles/s41392-021-00689-y

Association aspirine-famotidine (un anti-H2) : un espoir ?

In this analysis of 22,560 COVID-19 patients taking H1/H2 receptor antagonists, the combination of famotidine and aspirin did exhibit a significant synergistic survival benefit (OR 0.55, CI 0.39–0.78). The RR for death decreased by 32.5%—an immense benefit. The authors anticipate that at least three prospective RCTs that have been underway (NCT04504240, NCT04370262, and NCT04545008) will illuminate famotidine’s potential therapeutic profile.

15 juillet 2021

Barros-Martins J, Hammerschmidt SI, Cossmann A, et al. Immune responses against SARS-CoV-2 variants after heterologous and homologous ChAdOx1 nCoV-19/BNT162b2 vaccination. Nat Med Jul 14, 2021. https://www.nature.com/articles/s41591-021-01449-9

Pfizer vs AstraZeneca. meilleure immunisation par le premier au niveau cellulaire et humoral. Les auteurs déclarent qu'ils n'ont aucun conflit d'intérêt...

ChAdOx1 (Astra Zeneca)-primed immune responses before and 3 weeks after booster with ChAd (n=32) or BioNTech/Pfizer’s BNT162b2 (n=55): Although both vaccines boosted prime-induced immunity, BNT162b2 induced significantly higher frequencies of spike-specific CD4+ and CD8+ T cells and, in particular, high titers of neutralizing antibodies against the B.1.1.7, B.1.351 and P.1 variants.

Goldshtein I, Nevo D, Steinberg DM, et al. Association Between BNT162b2 Vaccination and Incidence of SARS-CoV-2 Infection in Pregnant Women. JAMA Jul 12, 2021; https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2782047?resultClick=1

Efficacité de 78% pendant la grossesse avec Pfizer. Une efficacité atténuée par les autres mesures de prévention mieux suivies pendant la grossesse.

This cohort included 7,530 vaccinated and 7,530 matched unvaccinated women, 46% and 33% in the second and third trimester, respectively. Adjusted hazard ratio for infection of 0.22 (95% CI, 0.11-0.43), corresponding to an estimate of vaccine effectiveness of 78%. The authors argue that benefit from the vaccine may be somewhat attenuated because pregnant women were generally advised to take extra precautions during the pandemic.

14 juillet 2021

Koehler J, Ritzer B, Weidlich S, et al. Use of monoclonal antibody therapy for nosocomial SARS-CoV-2 infection in patients at high risk for severe COVID-19: experience from a tertiary-care hospital in Germany. Infection July 6, 2021. https://doi.org/10.1007/s15010-021-01657-y

Anticorps monoclonaux : les essais continuent.

Because of an in-house transmission of SARS-CoV-2 infection, 11 patients received monoclonal antibodies shortly after an infection (eight cases received bamlanivimab, three received the combination of casirivimab and imdevimab), and prior to symptoms. Despite many risk factors, none of these 11 patients were admitted to the intensive care unit or died from any causes.

Barizien N, Le Guen M, Russel S, et al. Clinical characterization of dysautonomia in long COVID-19 patients. Sci Rep July 7, 2021, 11, 14042. https://www.nature.com/articles/s41598-021-93546-5

Dysautonomie : une explication pour la longue covid ?

A small study, indicating that dysautonomia (the failure or the increase of the sympathetic or para-sympathetic components activities in the autonomic nervous system) may explain the persistent symptoms observed in long COVID-19 patients, such as fatigue and hypoxia.

COVID-19 Host Genetics Initiative. Mapping the human genetic architecture of COVID-19. Nature July 8, 2021. https://www.nature.com/articles/s41586-021-03767-x

Nous ne sommes pas tous génétiquement égaux face à la covid-19.

An individual’s genetics can influence their risk of infection and the severity of disease symptoms. This large international study has identified parts of the human genome that can affect the risk of severe COVID-19. Three genome-wide association meta-analyses comprised of up to 49,562 COVID-19 patients from 46 studies identified a total of 13 genome-wide significant loci associated with SARS-CoV-2 infection (n = 4) or severe manifestations of COVID-19 (n = 9). Several of these loci correspond to previously documented associations to lung or autoimmune and inflammatory diseases.

13 juillet 2021

Mahil SK, Bechman K, Raharja A, et al. The effect of methotrexate and targeted immunosuppression on humoral and cellular immune responses to the COVID-19 vaccine BNT162b2: a cohort study. Lancet Rheumatology July 08, 2021. https://www.thelancet.com/journals/lanrhe/article/PIIS2665-9913(21)00212-5/fulltext

Immunité cellulaire préservée mais immunité humorale diminuée chez des patients sous méthotrexate.

Seroconversion alone might not adequately reflect vaccine immunogenicity in individuals with immune-mediated inflammatory diseases receiving therapeutic immunosuppression. In 84 patients with psoriasis receiving immunosuppressive drugs, seroconversion rates were lower in patients receiving immunosuppressants (78%), compared to 17 controls (100%), with the lowest rate in those receiving methotrexate (47%). However, cellular responses were preserved in almost all patients.

Hinks TS, Cureton L, Knight R, et al. Azithromycin versus standard care in patients with mild-to-moderate COVID-19 (ATOMIC2): an open-label, randomised trial. Lancet Resp Med July 09, 2021. https://www.thelancet.com/journals/lanres/article/PIIS2213-2600(21)00263-0/fulltext

Inefficacité confirmée de l'azithromycine chez des patients souffrant de Covid-19 léger à modéré.

In patients with mild-to-moderate COVID-19, adding azithromycin to standard care treatment did not reduce the risk of subsequent hospital admission or death.

12 juillet 2021

Planas D, Veyer D, Baidaliuk A. et al. Reduced sensitivity of SARS-CoV-2 variant Delta to antibody neutralization. Nature July 8, 2021. https://www.nature.com/articles/s41586-021-03777-9

Le Delta échappe partiellement mais de manière significative aux anticorps monoclonaux neutralisants et aux anticorps polyclonaux provoqués par une infection ou une vaccination antérieure par le SRAS-CoV-2. Les sérums d'individus ayant reçu une dose des vaccins Pfizer ou AstraZeneca ont à peine inhibé le variant delta. L'administration de deux doses a généré une réponse neutralisante chez 95% des individus, avec des titres 3 à 5 fois inférieurs contre le delta que contre l'alpha.

Delta partially but significantly escapes neutralizing mAbs, and polyclonal antibodies elicited by previous SARS-CoV-2 infection or vaccination. Sera from individuals having received one dose of either the Pfizer or AstraZeneca vaccines barely inhibited the delta variant. Administration of two doses generated a neutralizing response in 95% of individuals, with titers 3-to-5-fold lower against delta than alpha.

Abdelnabi R, Foo CS, De Jonghe S, et al. Molnupiravir inhibits the replication of the emerging SARS-CoV-2 variants of concern (VoCs) in a hamster infection model. The Journal of Infectious Diseases Juily 9, 2021, jiab361, https://academic.oup.com/jid/advance-article/doi/10.1093/infdis/jiab361/6318434

Molnupiravir, un espoir contre le delta et l'alpha... chez le hamster.

Molnupiravir, currently in Phase II clinical trials, has worked well in hamsters infected with either Wuhan strain, with the delta or alpha variants.

Dougherty K, Mannell M, Naqvi O, Matson D, Stone J. SARS-CoV-2 B.1.617.2 (Delta) Variant COVID-19 Outbreak Associated with a Gymnastics Facility — Oklahoma, April–May 2021. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. ePub: 9 July 2021. https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/70/wr/mm7028e2.htm?s_cid=mm7028e2_w

L'épidémie de delta peut indiquer que le retour au gymnase en 2021 n'est probablement pas la meilleure idée. Du 15 avril au 3 mai 2021, 47 cas de COVID-19 (les 21 cas testés étaient delta) étaient liés à une salle de gymnastique. Les taux globaux de diffusion dans des établissements et des familles étaient de 20 % et 53 %, respectivement. Il est à noter que quatre personnes (9 %) avaient reçu 2 doses de Moderna ou de Pfizer-BioNTech ou une dose unique du vaccin Johnson & Johnson ≥ 14 jours avant un résultat de test positif. Plusieurs facteurs de risque potentiels de transmission ont été identifiés, notamment le fait de ne pas utiliser de masques chez les participants actifs, couplé à une respiration accrue pendant la participation sportive active (en outre, la politique de l'établissement était que toutes les personnes ne participant pas activement portent des masques, mais cette politique n'était pas toujours suivie) ; mauvaise ventilation de l'installation.

This delta outbreak may indicate that return to gym in 2021 is probably not the best idea. During April 15–May 3, 2021, 47 COVID-19 cases (all 21 tested cases were delta) were linked to a gymnastics facility. The overall facility and household attack rates were 20% and 53%, respectively. Of note, four persons (9%) had received 2 doses of either the Moderna or Pfizer-BioNTech or a single dose of the Johnson & Johnson vaccine ≥ 14 days before a positive test result. Several potential risk factors for transmission were identified, including not using masks among active participants, coupled with increased respiration during active sport participation (further, facility policy was that all persons not actively participating wear masks, but this policy was not always followed); poor facility ventilation; staff members training multiple cohorts, etc.

11 juillet 2021

Nehme M, Braillard O, Chappuis F, et al. Prevalence of Symptoms More Than Seven Months After Diagnosis of Symptomatic COVID-19 in an Outpatient Setting. Annals Int Med July 6, 2021. https://www.acpjournals.org/doi/10.7326/M21-0878

Des symptômes persistants après infection par le SRAS-CoV-2 sont courants chez les personnes jeunes et en bonne santé suivies en ambulatoire. Sur les 629 participants qui ont honoré les entretiens de base, 410 ont effectué le suivi 7 à 9 mois après le diagnostic de COVID-19 ; 39,0 % ont signalé des symptômes résiduels. La fatigue (20,7 %) était le symptôme le plus fréquemment signalé, suivi de la perte du goût ou de l'odorat (16,8 %) et de la dyspnée (11,7 %).

Residual symptoms after SARS-CoV-2 infection are common among otherwise young and healthy persons followed in an outpatient setting. Of the 629 participants who completed the baseline interviews, 410 completed follow-up at 7 to 9 months after COVID-19 diagnosis; 39.0% reported residual symptoms. Fatigue (20.7%) was the most common symptom reported, followed by loss of taste or smell (16.8%) and dyspnea (11.7%).

Kadri SS, Sun J, Lawandi A, et al. Association Between Caseload Surge and COVID-19 Survival in 558 U.S. Hospitals, March to August 2020. Ann Int Med July 6, 2021. https://www.acpjournals.org/doi/10.7326/M21-1213

USA : près d'un décès sur quatre dus au COVID-19 était potentiellement attribuable à la charge excessive des hôpitaux mis à rude épreuve par l'augmentation du nombre de cas. Le renforcement des mesures préventives et le soutien aux hôpitaux  permettraient de sauver de nombreuses vies.

Nearly 1 in 4 COVID-19 deaths was potentially attributable to hospitals strained by surging caseload. Bolstering preventive measures and supporting surging hospitals will save many lives.

10 juillet 2021

Tarke A, Sidney J, Methot N, et al. Impact of SARS-CoV-2 variants on the total CD4+ and CD8+ T cell reactivity in infected or vaccinated individuals. Cell Rep July 01, 2021. https://www.cell.com/cell-reports-medicine/fulltext/S2666-3791(21)00204-4

Contre les variants, pas seulement l'immunité humorale mais aussi l'immunité cellulaire. Les lymphocytes T reconnaissent les variants : anglais, sud-africain, brésilien, californien.

The SARS-CoV-2 variants B.1.1.7, B.1.351, P.1 and CAL.20C do not significantly disrupt the total SARS-CoV-2 T cell reactivity. T cells of exposed donors or vaccinees effectively recognized SARS-CoV-2 variants.

The WHO Rapid Evidence Appraisal for COVID-19 Therapies (REACT) Working Group. Association Between Administration of IL-6 Antagonists and Mortality Among Patients Hospitalized for COVID-19A Meta-analysis. JAMA July 6, 2021. https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2781880?resultClick=1

Espoir dans les antagonistes de l'interleukine 6.

This prospective meta-analysis of 27 randomized trials included 10,930 patients. The 28-day all-cause mortality was lower among patients who received IL-6 antagonists compared with those who received usual care or placebo (summary odds ratio, 0.86). Administration of IL-6 antagonists was also associated with lower progression to IMV or death, cardiovascular support or death.

Vouga M, Favre G, Martinez-Perez O, et al. Maternal outcomes and risk factors for COVID-19 severity among pregnant women. Sci Rep Jul 6, 2021, 11, 13898. https://www.nature.com/articles/s41598-021-92357-y

Grossesse et covid : une association préoccupante.

In this large study, several risk factors for developing severe complications of SARS-CoV-2 infection among 926 pregnant women were identified including pulmonary co-morbidities, hypertensive disorders and diabetes. Obstetric and neonatal outcomes appear to be influenced by the severity of maternal disease.

Publié dans Covid-19, bibliographie

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